1、我國(guó)西南地區(qū)山羊品種資源豐富，其經(jīng)濟(jì)價(jià)值顯著。為解決傳統(tǒng)選育方法存在的不足之處，本研究在傳統(tǒng)方法的基礎(chǔ)上加入分子標(biāo)記輔助篩選，選用PRND、MAPK3、NPY和NPY-Y1R基因?yàn)楹蜻x基因，分析其在西南地區(qū)10個(gè)具有代表性的山羊品種中的多態(tài)性及其與繁殖性能之間的關(guān)系。為篩選山羊高繁殖力的標(biāo)記基因提供科學(xué)依據(jù)。
　　根據(jù)綿羊PRND基因的mRNA序列和牛PRND基因的DNA序列設(shè)計(jì)6對(duì)引物，采用單鏈構(gòu)象多態(tài)性（SSCP）方法檢測(cè)PR

2、ND基因在9個(gè)本土山羊品種和波爾山羊中的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism，SNP)。其中3對(duì)引物（P1、P2和P4）檢測(cè)出兩組共6種基因型（分別定義為AA、AB和BB，以及CC、CD和DD）。實(shí)驗(yàn)表明8個(gè)核苷酸位點(diǎn)存在突變。其中，G793A、C806T、G874C、T894C、T940G和G944A位于3’端區(qū)域；T28C為沉默突變，而A151G導(dǎo)致一個(gè)T51A氨基酸改變。另外，突變T28C和

3、A151G是完全連鎖的。在古藺馬羊、川東白山羊和貴州白山羊中，群體產(chǎn)羔數(shù)和個(gè)體初生重最小二乘值與PRND基因型均沒(méi)有顯著差異（P>0.05）。
　　參考牛的NPY-Y1R基因序列設(shè)計(jì)4對(duì)引物（P1~P4），采用SSCP檢測(cè)NPY-Y1R基因在9個(gè)本土山羊品種和波爾山羊中的SNPs。發(fā)現(xiàn)僅引物P4的擴(kuò)增片段具有多態(tài)性。P4在10個(gè)山羊品種中共檢測(cè)出AA、AB、BB和AC四種基因型，但未能發(fā)現(xiàn)CC基因型。測(cè)序結(jié)果顯示B等位基因與A等位

4、基因相比在6174堿基處發(fā)生了C→T的單堿基突變，C等位基因相對(duì)于A等位基因在6189處堿基存在C→T的單堿基突變。AB基因型在貴州白山羊和川東白山羊兩個(gè)群體中產(chǎn)羔數(shù)都顯著高于AA基因型（P<0.05），而在古藺馬羊、貴州白山羊和川東白山羊三個(gè)群體中AA型和AB型之間的初生重最小二乘均值沒(méi)有顯著差異（P>0.05）。本研究初步表明，NPY-Y1R基因可能是影響山羊產(chǎn)羔數(shù)性狀的一個(gè)主效基因，C6174T單堿基突變也有可能作為篩選山羊產(chǎn)羔數(shù)