中國荷斯坦牛C4A基因的遺傳變異及其作為乳腺炎抗性標記的可行性分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、補體成分4(Complement component4,C4)是補體經(jīng)典途徑和凝集素途徑中的一個重要成分,血清含量僅次于C3位居第二。在補體激活和抵抗外源微生物侵入中發(fā)揮著積極作用的C4,主要在肝臟中表達,一些肝外組織如心臟、肺臟、脾臟、腎臟、大腦、甲狀腺和乳腺中也有表達。C4是補體系統(tǒng)中多態(tài)含量最高的成分,其結構基因位于主要組織相容性復合物區(qū)。因此,研究C4意義更顯得重要。
   1.C4A基因多態(tài)性與奶牛生產性狀關聯(lián)性分析<

2、br>   本研究以1182頭中國荷斯坦牛,利用PCR-RFLP和DNA測序等方法檢測牛C4A基因中未報道的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點,并將發(fā)現(xiàn)的這些SNPs位點及其構建的不同單倍型組合與奶牛產奶性狀進行關聯(lián)性分析,篩查與奶牛產奶性狀相關的分子標記,為培育高產奶量、高乳蛋白及高乳脂率奶牛提供參考依據(jù)。通過C4濃度、抗菌活性和補體活性三個指標,驗證其抗性效果。
   序列分析比對顯示:外顯子10存在g.2994 A>G突變,

3、外顯子12含g.3508A>G和g.3649 G>C突變。試驗群體中SNPs組成的單倍型有8種,滿足統(tǒng)計分析數(shù)量的單倍型組合為7種。統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)g.2994 A>G-AG和g.3649 G>C-CC個體牛的SCS較其它基因型低(P<0.01); H5H5(GAC/GAC)為乳腺炎抗性單倍型組合,H2H1(AAG/AAC)是易感性群體。兩種組合對大腸桿菌和金黃色葡萄球菌的抗菌活性差異極顯著(P<0.001);各基因型C4濃度差異不顯著,但

4、H5H7個體較H5H5高(P<0.05)。
   2.C4A基因可變剪切體的尋找
   根據(jù)體細胞評分和奶樣病原菌鑒定結果,將6頭奶牛分為健康組和乳腺炎組。利用RT-PCR和克隆測序技術,在肝臟和乳腺組織中發(fā)現(xiàn)一種形式為內含子10保留的可變剪切體,即C4A-AS。兩種轉錄本在研究個體的心臟、腎臟、肝臟、脾臟、肺臟、肌肉、乳腺和舌中都有表達,且在健康奶牛組織中表達差異極顯著(P<0.001),在乳腺炎奶牛中差異不顯著(P=

5、0.257);乳腺炎發(fā)生時C4A-AS的表達量顯著增加(P=0.030)。
   3.C4A基因啟動子活性分析
   利用在線預測軟件對牛C4A基因的5'側翼區(qū)序列進行生物信息學分析,成功構建了一系列表達載體,利用雙熒光素酶報告基因檢測系統(tǒng)分析牛C4A基因的5'側翼區(qū)啟動活性。分別通過定點突變技術構建突變質粒和脂多糖刺激試驗,研究調控C4基本表達和誘導表達的轉錄因子結合位點。利用EMSA技術驗證轉錄因子在研究細胞系中存在

6、與否。
   C4A基因啟動子序列存在兩個SNP位點,即g.-889 C>T和g.+147 G>A。其中,位于內含子1的g.+147 G>A位點與血清C4濃度相關,可能調控C4的表達。C4A基因啟動子序列轉錄起始位點上游169 bp為報告基因熒光值最高的片段,即為啟動子核心區(qū);其中SP1(-169~-158)、E-box(-122~-117)和AP-1(-80~-71)是調控C4基本表達的主要轉錄因子結合位點。其中,AP-1在脂

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