豬鏈球菌2型強、無毒毒株定量分泌蛋白組學研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、[目的]:
  本文通過蛋白組學方法比較豬鏈球菌2型(Streptococcussuisserotype2,SS2)強、無毒株分泌蛋白,分析二者蛋白表達的差異,以期進一步了解SS2的致病機制明確該菌株間致病性存在差異的原因,對今后流行病學的調查有一定的指導意義。
  [方法]:
  本實驗以SPF巴馬小型豬及野生型斑馬魚作為動物模型,檢測了SS2菌株感染SPF巴馬小型豬后致病情況,并計算了接種斑馬魚96h內LD50值,

2、確定實驗菌株,強毒株SH-08和無毒株SH-07YH,并以該兩個菌株的基因組為模板,通過PCR的方法擴增與毒力相關的基因cps、mrp、epf、gdh、orf2、gapdh、sly初步判定各個菌株的毒力因子攜帶情況。
  根據(jù)各菌株培養(yǎng)平板計數(shù)(CFU)結果,對SH-08及SH-07YH菌液,以每1h為間隔,按照倍比稀釋法進行CFU計數(shù)及OD600測定,繪制兩菌株生長曲線,比較細菌生長情況。在菌液OD600為0.4時(前對數(shù)期),

3、收集菌株的表達上清。按照CFU值定量取SH-08及SH-07YH培養(yǎng)上清量(分別為50ml及76.5ml),并通過BCA技術進行蛋白定量。隨后通過SDS-PAGE技術初步分析兩菌株分泌蛋白表達圖譜,評估后續(xù)定量蛋白組學實驗的可行性。
  首先通過胰酶分解上清蛋白,采用液質聯(lián)用及串聯(lián)質譜技術進行鑒定研究(ThermoQuest),隨后經(jīng)電噴霧方法,按照質荷比為400至2000范圍進行全掃描,經(jīng)SEQUEST軟件分析,將肽段信息與SW

4、ISSPORT數(shù)據(jù)庫中所有的鏈球菌種信息進行匹配。運用DeCyderMS軟件將肽段質譜信息轉化為類似雙向電泳圖形式,評價試驗結果質量。基于定量比較蛋白組學的結果,在強毒株SH-08中特異性和高表達的蛋白用PCR和RT-PCR方法進行驗證。
  采用在線免費軟件SignaIP2.0.B2(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-2.01)進行目的蛋白信號肽預測分析,含有信號肽蛋白通過PSORTI

5、(http://psort.nibb.ac.jp/)軟件進一步分析目的蛋白的細胞定位。
  選擇在強毒株SH-08及弱毒株SH-07YH中共表達,且在強毒株SH-08中表達上調的蛋白,將其定量蛋白數(shù)據(jù)及定量PCR數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計線型回歸分析(SPSS16.0),確定蛋白高表達與轉錄水平的相關性。
  [結果]:
  (1)動物致病力實驗,SPF巴馬小型豬在感染強毒株SH-08后均出現(xiàn)急性敗血癥并死亡,而無毒株SH-07YH

6、感染后只有輕微的發(fā)熱現(xiàn)象。斑馬魚(LD50)結果表明菌株SH-08的毒力遠高于SH-07YH,明確了兩株細菌的致病力,為接下來的研究奠定了基礎。
  (2)PCR方法擴增與毒力相關基因,表明SH-08與背景已知的強毒株ZY05719所含的主要毒力基因一致,相比而言,無毒株SH-07YH僅缺失了毒力基因fbps,而其他大部分毒力基因都存在,推測毒力因子缺失并非是造成致病力差異的關鍵原因。
  (3)SDS-PAGE電泳鑒定SH

7、-08與SH-07YH上清蛋白表達基本一致,但SH-08菌株存在更多的蛋白條帶,部分蛋白條帶表達量相比SH-07YH顯著上調。結果證實后續(xù)定量蛋白組學實驗具有可行性。
  (4)本研究通過基于非標定量蛋白組學方法,結合DecydeMS軟件進行豬鏈球菌2型強毒株SH-08及弱毒株SH-07YH分泌蛋白進行定量研究,結果證實了相比弱毒株SH-07YH,強毒株SH-08含有11個高表達分泌蛋白,29個特異性分泌蛋白。推測這些差異表達的蛋

8、白可能與菌株毒力相關,為豬鏈球菌2型的毒力因子研究奠定了基礎,為后續(xù)致病機制研究提供借鑒。
  [結論]:
  (1)應用野生型斑馬魚作為動物模型,比較了SS2菌株ZY05719、SH-07YH和SH-08之間的LD50。其中ZY05719株LD50值最低,其次為SH-08株,SH-07YH株LD50值則最高。表明菌株SH-08的毒力遠高于SH-07YH。
  (2)本研究通過基于非標定量蛋白組學方法,結合Decyde

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