楊樹與玉米細(xì)胞周期蛋白基因家族全基因組研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、植物細(xì)胞周期蛋白家族基因的研究是近年來植物遺傳學(xué)和分子生物學(xué)所關(guān)注的熱點問題。綜述部分主要介紹了近年來植物細(xì)胞周期蛋白的研究進(jìn)展,包括細(xì)胞周期過程,細(xì)胞周期調(diào)控,細(xì)胞周期蛋白依賴激酶(CDK),細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶抑制因子(CKI)和細(xì)胞周期素(cyclin)。此外,對近幾年研究的細(xì)胞周期蛋白家族的前景進(jìn)行了簡要的評述。另一方面,生物信息學(xué)作為計算機(jī)科學(xué)與生物學(xué)的交叉學(xué)科,生物數(shù)據(jù)庫及生物信息分析是其主要研究內(nèi)容。綜述部分概述了核酸數(shù)

2、據(jù)庫、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫及其集成系統(tǒng),并簡介生物信息學(xué)在植物細(xì)胞周期蛋白家族研究中常用的信息學(xué)軟件,例如序列分析軟件——DNATOOLS,序列多種排列軟件——ClustalW/X,系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建軟件——MAGA以及MEME。細(xì)胞周期蛋白家族是細(xì)胞周期蛋白依賴激酶(CDK)的正向調(diào)控因子,并在細(xì)胞周期調(diào)控中發(fā)展著重要作用。盡管有研究已經(jīng)揭示了一些植物cyclin基因的功能和機(jī)制,但是在玉米中被研究的cyclin基因數(shù)量還是相當(dāng)稀少。
  

3、 在研究論文部分中,對玉米中含cyclinN結(jié)構(gòu)域的候選基因進(jìn)行了全基因組的分析研究,這包括對它們的確認(rèn)、系統(tǒng)發(fā)生學(xué)關(guān)系分析、物理位置分布分析、保守序列分析、基因復(fù)制研究等等,并且對水稻細(xì)胞周期蛋白家族基因分析結(jié)果進(jìn)行對照,取得如下結(jié)果:
   1.我們在玉米B73品種中找到了59個cyclin基因,根據(jù)進(jìn)化樹分析,將這59個基因分為A,B,D,F(xiàn),SDS和T六個亞族,相應(yīng)地,每個亞族成員的數(shù)目分別為11,10,21,6,4,

4、和7。
   2.在水稻與玉米cyclin基因構(gòu)造的進(jìn)化樹中,六個類型亞族(A,B,D,F(xiàn),T和SDS亞族)為水稻和玉米共有,水稻中含有H,L和P亞族,而玉米中沒有發(fā)現(xiàn)這三個亞族。
   3.研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)在玉米的五條染色體中,cyclin基因經(jīng)歷了7組串聯(lián)基因復(fù)制事件,然而與水稻不同的是,玉米中并沒有發(fā)現(xiàn)片段基因復(fù)制。
   4.在楊樹中找到了50個cyclin基因,根據(jù)進(jìn)化樹分析,被分為A、B、C、D、T、J

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