葉籽銀杏trnS-trnG序列分析及系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf_第1頁
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1、銀杏(Ginkgo biloba L.)是第四紀(jì)冰川之后唯一在我國保存下來的一孑遺物種,素有“活化石”之稱。在其漫長(zhǎng)的演化歷程中,銀杏的種子和葉片發(fā)生了明顯的變異。1891年,Shirai在日本發(fā)現(xiàn)世界上第一株葉籽銀杏(Ginkgo biloba L.var.epiphylla Mak.),1982年,董春耀發(fā)現(xiàn)在山東省沂源縣的一株葉籽銀杏,1984年,郭善基對(duì)其進(jìn)行了報(bào)道,這是在我國發(fā)現(xiàn)的第一株葉籽銀杏。作為銀杏家族中的特異種質(zhì)資源,

2、葉籽銀杏具有重要的觀賞價(jià)值和科研價(jià)值。目前對(duì)于葉籽銀杏研究主要集中形態(tài)學(xué)觀察,而對(duì)于葉籽銀杏的分類地位及系統(tǒng)進(jìn)化尚無定論,因此,需要從分子技術(shù)方面探討葉籽銀杏的變異機(jī)制。 本研究以2株銀杏和來自中國的26株葉籽銀杏、日本的1株葉籽銀杏為試材,使用Hamilton等(1999)設(shè)計(jì)的trnS-trnG序列通用引物:上游引物(5'-GCCGCTTTAGTCCACTCAGC-3')和下游引物(5'-GAACGA-ATCACACTTTT

3、ACCAC-3'),用PCR方法從銀杏和葉籽銀杏總DNA中擴(kuò)增trnS-trnG基因片段,并用DH5a大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行克隆,在含氨芐青霉素和涂布IPTG/X-gal的LB平板上進(jìn)行藍(lán)白斑篩選后從菌液中提取質(zhì)粒經(jīng)PCR檢測(cè),陽性克隆重組用于測(cè)序。用ClustalX1.83程序進(jìn)行對(duì)位排序,對(duì)齊后的序列加以人工檢驗(yàn),用得到的序列構(gòu)建基因樹。 克隆測(cè)得的27株葉籽銀杏和2株銀杏樣品的trnS-trnG基因序列的長(zhǎng)度大

4、部分是1005bp,最短的為來自沂源的YZ4。序列分析結(jié)果表明,trnS-trnG基因序列T堿基含量多。T、C、A、G四種堿基的平均含量分別為31.28%、19.43%、31.04%和18.24%,各樣品間的堿基含量差異極小。葉籽銀杏trnS-trnG序列富含A/T。27株葉籽銀杏和2株銀杏樣品的trnS-trnG基因序列排序后長(zhǎng)度為1008bp,包括34個(gè)堿基變異位點(diǎn),變異類型均為堿基的替換,其中包括三個(gè)信息位點(diǎn),分別位于34bp、3

5、7bp和359bp處。 基于trnS-trnG基因序列各樣品間的K2p遺傳距離為0~0.0081,平均遺傳距離為0.0027,遺傳距離極小,在種內(nèi)變異的范圍之內(nèi)。trnS-trnG基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹,樹長(zhǎng)為684步,一致性指數(shù)(CI)為0.9853,保持性指數(shù)(RI)為0.8361。其嚴(yán)格一致樹的一致性指數(shù)較高,說明trnS-trnG序列在銀杏和葉籽銀杏之間發(fā)生變異的頻率非常低,銀杏和葉籽銀杏樣品之間沒有得到很好的分支,來

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