水稻U-Box蛋白質(zhì)在不同發(fā)育時期的表達(dá)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、背景:真核生物基因組中廣泛存在U-BoX基因,其編碼蛋白質(zhì)大部分是泛素系統(tǒng)中決定底物特異性識別的E3蛋白質(zhì),其構(gòu)象與RING-finger 極其相似。U-BoX蛋白質(zhì)能促進(jìn)底物蛋白質(zhì)泛素化降解,對細(xì)胞內(nèi)異常蛋白質(zhì)的降解及質(zhì)量控制方面發(fā)揮著重要的作用。水稻基因組中有77個U-BoX蛋白質(zhì),系統(tǒng)了解他們的表達(dá)可為功能研究提供數(shù)據(jù)。
   研究目的:制備針對水稻U-BoX蛋白質(zhì)的抗體,了解水稻中U-BoX蛋白質(zhì)在不同發(fā)育時期的表達(dá)信息

2、,為功能研究積累數(shù)據(jù)。
   材料與方法:選取5個水稻U-BoX蛋白質(zhì),其共同結(jié)構(gòu)特點為U-BoX結(jié)構(gòu)在N端,C 端有ARM 結(jié)構(gòu)重復(fù)。用計算機(jī)軟件預(yù)測抗原決定簇,細(xì)菌體系體外表達(dá)、純化U-BoX蛋白質(zhì)的片段,免疫動物制備多克隆抗體,用Western blotting 檢測U-Box蛋白質(zhì)在水稻品種93-11 苗期地上部和地下部、分蘗期根和莖、孕穗期劍葉和幼穗、開花期劍葉和穗子、成熟期劍葉和種子中的表達(dá),并與EST數(shù)據(jù)庫中公布的

3、U-Box基因EST數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較分析。
   結(jié)果:體外克隆表達(dá)后,獲得了純化的蛋白質(zhì),制備的抗體特異性強(qiáng),Westernblotting 檢測可見一條明顯的主帶,其中Os06g01304和Os12g38210兩個蛋白質(zhì)的表觀分子量與預(yù)測分子量相符,Os01g66130、Os02g49950和Os08g01900 三個蛋白質(zhì)的表觀分子量低于預(yù)測分子量。5個U-BoX蛋白質(zhì)在水稻生長發(fā)育的不同時期或部位基本上是組成型表達(dá),且表達(dá)

4、量接近。對NCBI上公布的來自274個文庫的100 萬條以上的EST 進(jìn)行分析,可以看出5個U-BoX蛋白質(zhì)EST的數(shù)量分布大致均勻,與Westernblotting 結(jié)果揭示的組成型表達(dá)平行,與ATPase、HSP81-3、EGF-1 alpha和RuBisCo等對照基因相比,U-BoX基因的EST數(shù)目相對很少,說明它們屬于低豐度轉(zhuǎn)錄的基因。
   結(jié)論:選取5個水稻U-BoX蛋白質(zhì),通過抗原決定簇預(yù)測,表達(dá)片段蛋白質(zhì),制備了

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