豬CREB家族基因的克隆及表達(dá)研究的初步探討.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、CREB(cAMP反應(yīng)元件結(jié)合蛋白)/ATF(激活轉(zhuǎn)錄因子)家族是真核生物中廣泛存在的一類基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子,該家族共同的結(jié)構(gòu)特征是堿性亮氨酸拉鏈(bZIP)模體。CREB/ATF家族蛋白涉及到細(xì)胞的增殖、分化、凋亡、胞外刺激和應(yīng)激反應(yīng)等細(xì)胞生命過程。CREB2、CREB3和CREB3L4是ATF/CREB家族中三個(gè)重要的成員。
   本文以梅山豬為研究對(duì)象,首次對(duì)豬CREB家族的這三個(gè)基因及CREB3L4的剪接體進(jìn)行了基因克隆,通過

2、PCR擴(kuò)增獲取基因組序列并對(duì)其進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析,利用輻射雜種細(xì)胞板技術(shù)和半定量RT-PCR等方法進(jìn)行了基因的染色體定位和組織表達(dá)分析:另外還克隆豬CREB3啟動(dòng)子區(qū)域并構(gòu)建了pGL3熒光素酶報(bào)告載體,利用實(shí)時(shí)定量PCR方法檢測(cè)脂多糖刺激后CREB3 mRNA相對(duì)表達(dá)量,并利用雙熒光素酶檢測(cè)試劑盒檢測(cè)脂多糖刺激后CREB3的啟動(dòng)子活性是否變化。研究結(jié)果如下:
   1.?dāng)U增得到豬CREB家族三個(gè)成員的的cDNA序列,包含全長(zhǎng)編碼區(qū)

3、及部分非編碼區(qū),并對(duì)其進(jìn)行了生物信息學(xué)的分析。其中CREB2編碼區(qū)為1047 bp,編碼378個(gè)氨基酸; CREB3編碼區(qū)為1098 bp,編碼375個(gè)氨基酸; CREB3L4 varant1和varant2編碼區(qū)分別為1188bp和816bp,分別編碼395和271個(gè)氨基酸。在蛋白質(zhì)水平上,CREB2與人、小鼠CREB2分別享有85.8%,71.7%的相似性;CREB3與人、小鼠CREB3分別享有72.6%和65.0%的相似性;CRE

4、B3L4與人、小鼠CREB3L4分別享有82.5%和61.1%的相似性。
   2.?dāng)U增獲得CREB家族這三個(gè)成員的基因組序列并分析它們的基因結(jié)構(gòu)。CREB2基因組長(zhǎng)度為2069bp,包含三個(gè)外顯子和兩個(gè)內(nèi)含子;CREB3基因組長(zhǎng)度大約為5.3kb,包含九個(gè)外顯子和八個(gè)內(nèi)含子;CREB3L4基因組長(zhǎng)度大約為6.3kb,包含十個(gè)外顯子和九個(gè)內(nèi)含子。這三個(gè)基因所有的外顯子和內(nèi)含子的交界都符合GT/AG法則。根據(jù)所得到的基因組序列,利

5、用輻射雜種板技術(shù)將CREB2、CREB3和CREB3L4分別定位在5p、1q28和4q。并且通過比對(duì)豬-人比較基因組圖譜證實(shí)這兩個(gè)基因的定位結(jié)果與人相應(yīng)基因在染色體上的位置相對(duì)應(yīng)。
   3.以梅山豬的脂肪組織、骨骼肌、心、胃、肝、肺、脾、腸、腦、腎、淋巴等十一個(gè)組織樣品為材料,利用半定量RT-PCR的方法研究了CREB家族這三個(gè)成員在mRNA水平上的組織表達(dá)譜。結(jié)果表明CREB2、CREB3和CEEB3L4在組織中廣譜性表達(dá)。

6、CREB2和CREB3均在白色脂肪組織、胃、腎肺、小腦、肝臟和淋巴幾個(gè)組織中高表達(dá)。CEEB3L4 variant1在肝臟和胃中表達(dá)量較高,中度表達(dá)與小腦中,其次是脾、白色脂肪組織和淋巴組織,然而在骨骼肌和腎中表達(dá)量極低。另外,與CEEB3L4 variant1相比,CEEB3L4 variant2普遍在組織中以極低的水平表達(dá),說明CEEB3L4 variant1是組織中CEEB3L4存在的主要形式。
   4.為了研究CREB

7、3的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,我們克隆得到CREB35’端上游區(qū)域啟動(dòng)子區(qū)域1926bp,并進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分析,發(fā)現(xiàn)在GC box元件上游有4個(gè)SP1識(shí)別位點(diǎn)、1個(gè)NF-κB位點(diǎn)、2個(gè)AP1位點(diǎn)和1個(gè)AP2位點(diǎn)。進(jìn)而構(gòu)建插入了此段區(qū)域的熒光素酶報(bào)告載體,檢測(cè)到此段區(qū)域具有較強(qiáng)的啟動(dòng)子活性。
   5.用濃度為1μg/ml的脂多糖(LPS)分別刺激豬IBRS-2和小鼠RAW263.7細(xì)胞,使用qRT-PCR方法檢測(cè)CREB3的表達(dá)變化。

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