1、黃瓜花葉病毒(Cucumber mosaic virus，CMV)是典型的三分體正義單鏈RNA(Positive sense single-stranded RNA，+ssRNA)病毒，CMV屬于雀麥花葉病毒科(Bromoviridae)黃瓜花葉病毒屬(Cucumovirus)。本研究對409份病毒病樣品進(jìn)行了CMV的ELISA檢測，對部分CMV陽性樣品進(jìn)行了CMV的基因組擴(kuò)增，并進(jìn)行了生物信息學(xué)分析，得到以下研究結(jié)果:
　　1.

2、ELISA檢測結(jié)果顯示全國409份樣品中有123個樣品為CMV陽性，檢出率為30.1％，除了福建省，其它省區(qū)均檢測CMV的侵染，安徽宣城煙區(qū)的26個樣品中有19個呈CMV陽性，檢出率高達(dá)73.1％，最低檢出率的遼寧煙區(qū)也有11.8％，可見CMV在我國主要煙區(qū)分布廣泛，危害十分嚴(yán)重。
　　2.11個CMV分離物基因組序列之間兩兩比對結(jié)果顯示，分離物11XC02亞組Ⅱ代表株系Q的序列同源性較高，與亞組IA和亞組IB代表株系的同源性較低

3、，而其它10個分離物則與11XC02相反，與亞組Ⅱ株系Q的同源性較低，而與亞組IA和IB的同源性較高，這表明分離物11XC02屬于亞組Ⅱ株系，而其它10個分離物屬于亞組Ⅰ;從RNA35'UTR結(jié)構(gòu)比較圖也能看出，11XC02與亞組Ⅱ株系結(jié)構(gòu)相似，其它10個分離物與亞組IB相似;系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系顯示11XC02與CMV亞組Ⅱ株系聚在一組，親緣關(guān)系較近，而其它10個分離物則與亞組IB株系親緣關(guān)系較近，其中CP基因系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示分離物Shilin

4、和XC09與亞組Ⅱ株系分在一組，較亞組IB親緣關(guān)系更近，這說明分離物Shilin和XC09的CP基因區(qū)域可能發(fā)生了變異，使得它們的進(jìn)化關(guān)系更加趨近于亞組IA。
　　3.RDP4軟件分析顯示，本研究中有11個重組事件。3條RNA分子都有重組事件發(fā)生，其中RNA1分子的3個重組是亞組IB的組間重組，RNA2分子的2個重組也是亞組IB的組間重組，Shilin和XC09等5個重組分離物的RNA3分子發(fā)生6個重組事件，都是亞組IA和IB之間