大白菜PHK1基因的分離和序列分析.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、植物在生長發(fā)育過程中,會(huì)頻繁地受到干旱,鹽漬和凍害等滲透脅迫條件的影響。植物在長期的進(jìn)化過程中,建立了適應(yīng)這些脅迫條件的分子調(diào)控機(jī)制。植物細(xì)胞對(duì)脅迫的應(yīng)答過程是一個(gè)信號(hào)感應(yīng)和傳遞并最終做出細(xì)胞學(xué)反應(yīng)的過程。對(duì)植物細(xì)胞滲透脅迫應(yīng)答信號(hào)通路的研究取得了許多進(jìn)展,多集中于信號(hào)的傳遞、細(xì)胞反應(yīng)和相關(guān)基因的表達(dá)上,已鑒定出調(diào)節(jié)信號(hào)傳遞和逆激基因表達(dá)的蛋白質(zhì)因子(如DREB,MAPK以及磷脂酶等)以及一些直接起保護(hù)作用的蛋白質(zhì)(如脯氨酸合成酶、抗凍

2、蛋白、巰基蛋白酶等)。但是對(duì)于植物如何感應(yīng)脅迫信號(hào)卻不甚清楚。直至近幾年,隨著擬南芥基因組學(xué)的研究取得突飛猛進(jìn)的進(jìn)展,從擬南芥中分離出AHK1(Arabidopsis histidine kinase1)基因,這方面的研究才有了突破。AHK1是擬南芥HK家族成員之一,是一種雜合型的組氨酸蛋白激酶,具有保守的信號(hào)輸入結(jié)構(gòu)域、傳遞結(jié)構(gòu)域和接受結(jié)構(gòu)域。在擬南芥中,AHKl參與調(diào)控抗?jié)B透脅迫的應(yīng)答反應(yīng),與酵母中的滲透感受器SLN1功能類似。

3、r>   本論文工作旨在從大白菜中分離一個(gè)未知的與擬南芥AHK1同源的基因,作者將其命名為PHK1(Pekinensis Histidine Kinase1)。
   實(shí)驗(yàn)中通過反向PCR、常規(guī)PCR、Genome Walking等分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)及生物信息學(xué)方法的綜合運(yùn)用,從大白菜中分離出7598 bp的包括PHK1基因在內(nèi)的DNA序列,以及2848 bp的PHK1基因cDNA序列。
   運(yùn)用GENSCAN、CD

4、D、SWISS-MODEL、Clustal X、RNAdraw等在線的分析程序,對(duì)PHK1基因的序列信息進(jìn)行整理、分析,預(yù)測(cè)得到了PHK1的開放閱讀框2589bp,其編碼的肽鏈長度為862個(gè)氨基酸,與擬南芥AHK1基因的CDS和氨基酸序列的相似性分別為85.68%和88.57%。保守結(jié)構(gòu)域及無根進(jìn)化樹分析顯示,PHK1具有完整的傳遞結(jié)構(gòu)域和接受結(jié)構(gòu)域,而且與AHK1的親緣關(guān)系最近。PHK1基因的3’UTR區(qū)有208bp,與擬南芥AHK1

5、基因的3’UTR區(qū)的相似性僅為66.86%,低于編碼區(qū)序列的相似性,但二者用RNAdraw預(yù)測(cè)的二級(jí)結(jié)構(gòu)相似。
   綜合論文的實(shí)驗(yàn)及分析結(jié)果得出從大白菜中分離到了一個(gè)未知的與擬南芥AHK1同源的PHK1基因。推測(cè)PHK1可能作為滲透感受器在大白菜中感知外界信號(hào)的變化,并參與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程,激活相應(yīng)的應(yīng)答機(jī)制來減輕滲透脅迫造成的損害。進(jìn)一步的驗(yàn)證分析工作仍在繼續(xù)中。
   大白菜是一種重要的蔬菜作物。研究其對(duì)滲透脅迫感應(yīng)的

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