花生脂肪酸代謝關(guān)鍵酶基因的克隆與表達分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、花生是我國主要油料作物,其總產(chǎn)居各油料作物之首,花生品質(zhì)改良育種對我國的經(jīng)濟發(fā)展具有重要意義。傳統(tǒng)的育種技術(shù)周期長,特定成分提高幅度有限,農(nóng)藝性狀難以綜合。基因工程為作物品種遺傳改良提供了一個高效的技術(shù)手段,可以大大縮短育種周期和提高育種效率。因此,應用基因工程技術(shù)對花生脂肪酸組分改良具有重要理論與實踐意義。 本研究以花生品種E12幼苗為材料提取總RNA,并分離mRNA,利用SMART(Switching Mechanism a

2、t5'end of RNA Transcript)技術(shù)合成雙鏈cDNA。經(jīng)限制性內(nèi)切酶Sfi I酶切,將經(jīng)過分級分離得到的cDNA連接到改造的質(zhì)粒載體pBluescriptIISK,構(gòu)建了花生幼苗cDNA文庫。經(jīng)檢測,所構(gòu)建文庫的滴度為1.1×106cfu/mL,重組率為93.4%,插入片段大小為750~2000bp。利用高通量測序技術(shù)獲得大批高質(zhì)量序列,利用生物信息學方法進行Unigene歸并和序列注釋分析,得到了4074條Unige

3、nes,其中3897條序列有相關(guān)同源信息。 從構(gòu)建的cDNA文庫中獲得了兩個磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,簡稱PEPC)基因片段(編號為HS096-h02和HS092-d05),通過RACE和RT-PCR方法,獲得兩個花生PEPC基因序列,分別命名為AhPEPC1(GenBank登錄號:EU391629)和AhPEPC2(GenBank登錄號:FJ222240);同時,根

4、據(jù)公布的擬南芥PEPC基因家族的4個基因和大豆PEPC基因家族的5個基因,設計簡并引物,利用RACE技術(shù)結(jié)合RT-PCR方法,從花生中分離了另外三個PEPC基因,分別命名為AhPEPC3(GenBank登錄號:FJ222826),AhPEPC4(GenBank登錄號:FJ222827)和AhPEPC5(GenBank登錄號:FJ222828)。AhPEPC1-5基因開放閱讀框長度為2,907bp,2,901bp,2,901bp,2,91

5、0bp和3,111bp;分別編碼968,966,966,969和1036個氨基酸殘基。熒光定量PCR結(jié)果顯示,花生AhPEPC1、AhPEPC2、AhPEPC3、AhPEPC4和AhPEPC55個基因在普通花生和高油分花生品種的四種不同組織(根、莖、葉和種子)中都有表達,表達模式各不相同。除AhPEPC2外,AhPEPC1、AhPEPC3、AhPEPC4、AhPEPC5四個基因在普通花生中的表達量均顯著高于高油分花生品種。 從構(gòu)

6、建的cDNA文庫中還獲得了一個花生β-酮脂酰-ACP合成酶II(beta-ketoacyl-ACP synthetase II,簡稱KAS II)基因和一個硬脂酰-載體蛋白去飽和酶(Stearoyl-ACP desaturase,簡稱SAD)基因的部分序列(編號為HS137 H08),以此為基礎,利用RACE方法擴增得到包含這兩個基因完整編碼區(qū)的cDNA序列,分別命名為AhKAS II(GenBank登錄號:FJ358425)和AhSA

7、D(GenBank登錄號:FJ230310)。獲得的AhKAS II序列長度為1867bp,編碼404個氨基酸;AhSAD序列長度為1499bp,編碼406個氨基酸。采用熒光定量PCR技術(shù)對這兩個基因在不同花生品種、不同花生組織(根、莖、葉和種子)中的表達分別進行研究,結(jié)果表明這兩個基因在花生不同組織中的表達差異都十分顯著,AhKAS II基因在種子中的表達最為突出,AhSAD在種子和葉中的表達量最高,推測這兩個基因可能在植物種子的生長

8、發(fā)育過程中起重要的作用,另外不同花生品種間的基因表達量也存在差異。 利用生物信息學方法,從普通花生和高油酸花生品種中分別獲得了△12脂肪酸脫氫酶基因的全長cDNA序列,分別命名為AhFAD2B和AhFAD2B'。分析兩個基因的編碼區(qū)序列發(fā)現(xiàn),AhFAD2B'基因序列在起始密碼子后第442 bp處有堿基A的插入,導致編碼區(qū)提前終止,編碼一個截短蛋白AhFAD2B',丟失了一個膜結(jié)合蛋白保守的組氨酸框。表達分析顯示,AhFAD2B在

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