微陣列比較基因組雜交分析18等臂雙著絲粒染色體胎兒全基因組拷貝數(shù)變化_第1頁(yè)
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1、1微陣列比較基因組雜交分析微陣列比較基因組雜交分析1818等臂雙著絲粒染色體胎兒全等臂雙著絲粒染色體胎兒全基因組拷貝數(shù)變化的實(shí)驗(yàn)研究基因組拷貝數(shù)變化的實(shí)驗(yàn)研究張艷亮1,戴勇1,2,涂植光1,李啟運(yùn)2,曾君2,林秀華2,張麗21重慶醫(yī)科大學(xué)教育部臨床檢驗(yàn)診斷學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,重慶市,4000162暨南大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院(深圳市人民醫(yī)院),深圳市,518082【摘要摘要】目的目的了解18q等臂雙著絲粒染色體[idic(18)(p11→qter)

2、]胎兒全基因組拷貝數(shù)變化的情況,確定idic(18)(p11→qter)的結(jié)構(gòu)和組成,探討微陣列比較基因組雜交在分子細(xì)胞遺傳診斷中運(yùn)用的可行性和優(yōu)越性。方法方法運(yùn)用微陣列比較基因組雜交芯片對(duì)一被傳統(tǒng)G顯帶和熒光原位雜交診斷為idic(18)(p11→qter)的胎兒進(jìn)行全基因組高分辯率掃描和分析。結(jié)果結(jié)果微陣列比較基因組雜交顯示胎兒存在18p11.21→pter缺失,18p11.21→qter復(fù)制,斷裂點(diǎn)位于12104527和12145

3、199(距離18p端粒),確定idic(18)(p11→qter)是idic(18)(p11.21→qter)。另外,還檢測(cè)出了21個(gè)亞顯微拷貝數(shù)變化。結(jié)論結(jié)論與傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳分析方法相比,微陣列比較基因組雜交不僅能準(zhǔn)確、高分辯率和高通量地檢測(cè)出基因組拷貝數(shù)變化,還能高分辯率地確定拷貝數(shù)變化的斷裂點(diǎn)。【關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞】微陣列比較基因組雜交;18等臂雙著絲粒染色體;拷貝數(shù)變化中圖分類號(hào)中圖分類號(hào):R3943Experimentalstudy

4、ofwholegenomiccopynumbervariationsinafetuswithadenovoisodicentricchromosome18byarraybasedcomparativegenomichybridizationZhangYanLiang1DaiYong12TuZhiGuang1LiQiYun2ZengJun2LinXiuHua2ZhangLi21KeyLabatyofLabatyMedicalDiagnos

5、ticsMinistryofEducation通訊作者:戴勇,暨南大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院(深圳市人民醫(yī)院),深圳市,518082。電話:0755255330182780。傳真:075525626750。Email:daiyong22@.cn。insituhybridizationFISH)、實(shí)時(shí)定量PCR(realtimequantitativePCR,RTqPCR)、多重連接介導(dǎo)的探針擴(kuò)增(multiplexligationdepende

6、ntprobeamplificationMLPA)和比較基因組雜交(comparativegenomichybridizationCGH)等都能用于CNVs的檢測(cè)和描述,但這些技術(shù)要么由于分辯率低,難以檢測(cè)亞顯微CNVs,更難以確定CNVs的大小和斷裂點(diǎn);要么由于低通量性,僅能對(duì)有限的基因組位點(diǎn)進(jìn)行分析,無(wú)法對(duì)整個(gè)基因組進(jìn)行篩查。最近,微陣列比較基因組雜交(arraybasedcomparativegenomichybridizatio

7、n,arrayCGH)作為一種新型的強(qiáng)大的細(xì)胞遺傳分析方法出現(xiàn)了,為細(xì)胞遺傳診斷和研究提供了一個(gè)新的平臺(tái)。ArrayCGH與傳統(tǒng)CGH的原理相似,但用吸附于固體載體(如玻片)上的大量DNA探針取代了中期染色體,分辨率達(dá)到了空前的高度。因此,ArrayCGH結(jié)合了傳統(tǒng)CGH高通量和FISH高分辨率等優(yōu)點(diǎn),一次檢測(cè)相當(dāng)于對(duì)基因組同時(shí)進(jìn)行了成千上萬(wàn)個(gè)獨(dú)立的FISH。本文運(yùn)用arrayCGH對(duì)一嚴(yán)重四肢畸形和心臟缺陷、傳統(tǒng)細(xì)胞遺傳診斷為18q等

8、臂雙著絲粒染色體[idic(18)(p11→qter)]的胎兒進(jìn)行全基因組掃描,了解胎兒全基因組CNVs的情況,探討arrayCGH在分子細(xì)胞遺傳診斷中運(yùn)用的可行性和優(yōu)越性。材料和方法材料和方法1病例資料一28歲孕3產(chǎn)0漢族孕婦,此次妊娠26w時(shí),超聲檢查發(fā)現(xiàn)胎兒雙側(cè)橈骨缺失并雙手畸形,雙側(cè)肱骨較短,右側(cè)足內(nèi)翻,TaussingBing綜合征(室間隔缺損,肺動(dòng)脈騎跨),雙側(cè)脈絡(luò)膜囊腫,頸項(xiàng)軟組織增厚。否認(rèn)近親結(jié)婚,否認(rèn)高血壓、糖尿病、腎

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