甘蔗部分磷素響應(yīng)關(guān)鍵基因的克隆及表達(dá)分析.pdf_第1頁(yè)
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1、磷素作為甘蔗生長(zhǎng)發(fā)育的必需肥料元素之一,在甘蔗生長(zhǎng)發(fā)育的各個(gè)階段起著至關(guān)重要的作用,如適量施磷不僅可以促進(jìn)甘蔗根、莖、葉等組織器官的形態(tài)建成,而且可以有效改善甘蔗莖徑、有效莖數(shù)、單莖重,進(jìn)而貢獻(xiàn)于甘蔗產(chǎn)量的增加。研究者們對(duì)我國(guó)多個(gè)蔗區(qū)調(diào)查研究發(fā)現(xiàn),大部分蔗區(qū)的有效磷含量仍處于中等以下水平,且蔗區(qū)的磷素利用效率也相對(duì)低下,僅為6.7%-15.3%。近年來(lái),人們通過(guò)對(duì)一些模式植物擬南芥、水稻進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),通過(guò)分子手段進(jìn)行磷高效種質(zhì)材料的改良

2、、創(chuàng)新可大大改善植物自身磷素利用率過(guò)低這一現(xiàn)狀。
  本研究以轉(zhuǎn)錄組測(cè)序建立的unigene數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ),對(duì)其中參與甘蔗磷素響應(yīng)調(diào)控基因進(jìn)行發(fā)掘。并以轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所獲序列為模板,設(shè)計(jì)特異性克隆引物,對(duì)其中的部分關(guān)鍵基因完成克隆和表達(dá)模式分析。旨在揭示甘蔗磷素響應(yīng)調(diào)控過(guò)程的相應(yīng)基因,為下一步進(jìn)行磷高效甘蔗種質(zhì)創(chuàng)新和篩選鑒定奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)果與結(jié)論如下:
  1.應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序建立的unigene數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)甘蔗磷素響應(yīng)調(diào)控基因完成注

3、釋?zhuān)瑥闹形覀児沧⑨尦?30條unigene信息,它們分別編碼甘蔗的ScPHR1-3(7條)、ScSPX1-6(12條)、ScPAP2(4條)、ScPHT1(13條)、ScPHO1;1-1;3(5條)等75個(gè)基因。
  2.應(yīng)用PCR克隆手段對(duì)其中注釋為甘蔗的ScPHR1-3、ScSPX1-6完成克隆。克隆結(jié)果顯示,甘蔗的ScPHR1基因cDNA序列全長(zhǎng)1539bp,編碼442個(gè)氨基酸;ScPHR2基因cDNA序列全長(zhǎng)1520bp,

4、編碼417個(gè)氨基酸;ScPHR3基因cDNA序列全長(zhǎng)1351bp,編碼393個(gè)氨基酸;ScSPX1基因cDNA序列全長(zhǎng)1639bp,編碼310個(gè)氨基酸;ScSPX2基因cDNA序列全長(zhǎng)2050bp,編碼278個(gè)氨基酸;ScSPX3基因cDNA序列全長(zhǎng)892bp,編碼259個(gè)氨基酸;ScSPX4基因cDNA序列全長(zhǎng)1893bp,編碼336個(gè)氨基酸;ScSPX5基因cDNA序列全長(zhǎng)889bp,編碼262個(gè)氨基酸;ScSPX6基因cDNA序列

5、全長(zhǎng)1533bp,編碼260個(gè)氨基酸。
  3.ScPHR1-3及ScSPX1-6基因編碼蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,它們均屬于親水性,不穩(wěn)定蛋白。等電點(diǎn)預(yù)測(cè)分析,除ScSPX3蛋白呈堿性外,其余的均呈現(xiàn)酸性。結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果表明,ScPHR1-3均屬于 MYB-CC基因家族,有且都包含有 MYB-DNA結(jié)合域和Coil-colied(CC)結(jié)合域;ScSPX1-6均屬于SPX大家族,且都含有一個(gè)SPX結(jié)構(gòu)域。同源比對(duì)和遺傳進(jìn)化分析結(jié)

6、果表明,甘蔗與高粱有著較近的遺傳關(guān)系,其次是玉米、水稻等。蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果表明,甘蔗ScPHR1-3及ScSPX1-6蛋白均不含跨膜結(jié)構(gòu);且在功能預(yù)測(cè)結(jié)果呈現(xiàn)一致性,均為轉(zhuǎn)運(yùn)和錨定。上述預(yù)測(cè)結(jié)果與水稻、擬南芥等植物分離出的該基因特征極為相似。
  4.以甘蔗的根、莖、葉、芽為組織材料,應(yīng)用qRT-PCR技術(shù)對(duì)甘蔗ScPHR1-3、ScSPX1-6基因組織特異性表達(dá)進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,甘蔗的這9個(gè)基因在甘蔗的不同組織部位中均有表

7、達(dá)。對(duì)PHR基因家族表達(dá)特征具體分析發(fā)現(xiàn),ScPHR1在根中的表達(dá)量最低,其次是莖、葉、芽;ScPHR3基因在莖中的表達(dá)量最低,其次是根、葉、芽;ScPHR2在根中的表達(dá)量最低,其次是莖、芽、葉。而對(duì)SPX基因家族分析顯示,其中除ScSPX6在芽中的表達(dá)量最低外,其余的基因均在根中的表達(dá)量為最低。除ScSPX1在葉中的表達(dá)量最高外,其余的均在莖中的表達(dá)量最高。
  5.對(duì)甘蔗ScPHR1-3基因亞細(xì)胞定位分析發(fā)現(xiàn),該基因家族中的S

8、cPHR1和ScPHR2定位于煙草表皮細(xì)胞的細(xì)胞核內(nèi),ScPHR3定位于煙草表皮細(xì)胞的細(xì)胞膜和細(xì)胞質(zhì)上。對(duì)ScSPX1-6基因亞細(xì)胞定位分析發(fā)現(xiàn),ScSPX1和ScSPX2定位于煙草表皮細(xì)胞的細(xì)胞核內(nèi);ScSPX3和ScSPX6定位于煙草表皮細(xì)胞的細(xì)胞膜和細(xì)胞質(zhì)上;ScSPX4和ScSPX5定位于煙草表皮細(xì)胞的細(xì)胞膜和細(xì)胞核上,且ScSPX5在細(xì)胞質(zhì)中也有所表達(dá)。結(jié)合結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)分析,ScPHR1和ScPHR2,ScSPX1和ScSP

9、X2基因可能參與細(xì)胞核內(nèi)物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)和錨定,而其他基因在這一特征上均呈現(xiàn)為多樣性,如它們均在細(xì)胞膜上有表達(dá),表明它們可能參與細(xì)胞膜內(nèi)外的轉(zhuǎn)運(yùn)和錨定,且ScSPX3、ScSPX5、ScSPX6還在細(xì)胞核內(nèi)被發(fā)現(xiàn),表明它們還可能參與細(xì)胞內(nèi)核質(zhì)間的物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)與錨定。此外,ScPHR3、ScSPX4與ScSPX5在胞質(zhì)中也存在有一定的表達(dá),因此,我們推測(cè)它們還可能參與細(xì)胞器間物質(zhì)的交流。
  6.原核表達(dá)分析結(jié)果表明,這9個(gè)基因在18℃用0.

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