高山金黃桿菌新種鑒定及鐵礦類芽胞桿菌CY1T的基因組分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、為開發(fā)和利用細(xì)菌資源,本研究從張家界天門山表層土中分離到23株細(xì)菌,其中以不動桿菌和金黃桿菌為主要菌屬。其中一株革蘭氏陰性、短桿狀細(xì)菌WG4T為金黃桿菌屬新種。16S rRNA基因序列分析顯示菌株WG4T與金黃桿菌Chryseobacterium anthropi NF1366T和Chryseobacterium haifense H38T的進(jìn)化關(guān)系最近,相似性分別為97.39%和97.05%,WG4T與這兩株菌株的DNA-DNA雜交結(jié)

2、果分別為63.3%和62.7%。通過對菌株WG4T進(jìn)行多相分類學(xué)分析,鑒定了該菌株生長溫度范圍為4-40℃,主要脂肪酸為iso-C15∶0(32.4%)、anteiso-C15∶0(21.8%)和iso-C17∶03-OH(17.2%),主要呼吸醌類型是MK-6,主要極性脂是磷脂酰乙醇胺(PE),基因組G+C含量為37.7mol%,以上特性均與金黃桿菌屬特性相吻合。但基于16S rRNA基因同源性、DNA-DNA雜交結(jié)果,及特殊生理生化

3、表型(不可水解明膠、可分解纖維二糖產(chǎn)酸等)結(jié)果,表明菌株WG4T為金黃桿菌屬的一個新種,將其命名為高山金黃桿菌,即Chryseobacterium montanum sp.nov.。
  此外,本研究組前期鑒定了一株鐵礦類芽胞桿菌新種Paenibacillus ferrariusCY1T,該菌可產(chǎn)生H2S氣體,可與重金屬反應(yīng)生成沉淀等性質(zhì)在重(類)金屬污染修復(fù)方面具有一定作用。本研究發(fā)現(xiàn)CY1T具有六種重(類)金屬抗性,代謝產(chǎn)生的

4、H2S可與Cd(Ⅱ)發(fā)生共沉淀作用,以及該菌具有還原Se(Ⅳ)和Cr(Ⅵ)的能力。通過全基因組測序得到CY1T的基因組草圖,包含了75個contigs,8,260個編碼基因,81個RNA基因。該基因組具有完整的SO42-還原通路,可將SO42-還原成S2-,生成H2S或可與Cd(Ⅱ)發(fā)生反應(yīng),生成CdS沉淀。同時,在基因組內(nèi)還可以找到與Se(Ⅳ)和Cr(Ⅵ)還原相關(guān)的蛋白,可能參與Se(Ⅳ)和Cr(Ⅵ)的還原反應(yīng)。體現(xiàn)了菌種CY1T在重

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