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文檔簡(jiǎn)介
1、蛋白質(zhì)是人類生命活動(dòng)息息相關(guān)的生物大分子,本文從計(jì)算科學(xué)的角度研究分析蛋白質(zhì)。本文主要分為兩個(gè)部分:第一部分通過分析提取蛋白質(zhì)的特征然后應(yīng)用SVM的方法從蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)出發(fā)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的可溶性;第二部分從統(tǒng)計(jì)模式分析并應(yīng)用計(jì)算機(jī)軟件方法,探索乙肝病毒氨基酸的變異模式。
1)在機(jī)器學(xué)習(xí)中,特征作為學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)的表示,特征選擇結(jié)果的好壞直接影響著分類器的分類精度和泛化性能,因此有效的特征選擇方法至關(guān)重要。支持向量機(jī)作為目前應(yīng)用最廣泛的
2、機(jī)器學(xué)習(xí)模型之一,在文本分類、圖像識(shí)別、生物信息學(xué)等各個(gè)方面都有重要的應(yīng)用。蛋白質(zhì)作為一切細(xì)胞、組織的重要成分,在生命活動(dòng)中扮演著決定性的作用,蛋白質(zhì)的是否可溶,決定了它是否能發(fā)揮功能,而且有一系列的疾病都是由于機(jī)體的蛋白質(zhì)可溶性發(fā)生變化造成的,因此,蛋白質(zhì)的可溶性的重要程度毋庸置疑。本文應(yīng)用SVM的模型,根據(jù)蛋白質(zhì)氨基酸的理化性質(zhì)以及蛋白質(zhì)的序列特征,從計(jì)算科學(xué)的角度出發(fā),訓(xùn)練出蛋白質(zhì)可溶性預(yù)測(cè)的模型,然后應(yīng)用得到的模型預(yù)測(cè)新的蛋白質(zhì)
3、序列的可溶性。經(jīng)過與前人工作的比較,我們得到分類效果較優(yōu)的蛋白質(zhì)可溶性特征以及預(yù)測(cè)模型。
2)乙型肝炎是一種流行性廣、危害嚴(yán)重的傳染性炎癥疾病,目前尚無徹底的根治方法,只能通過有效的疫苗接種來預(yù)防。本文應(yīng)用統(tǒng)計(jì)分析的方法,研究乙型肝炎病毒蛋白質(zhì)的變異數(shù)據(jù),分析該病毒四種蛋白質(zhì)中氨基酸的變異趨勢(shì),找到部分氨基酸變異的模式;然后運(yùn)用模式分析軟件,分析乙型肝炎病毒四個(gè)蛋白質(zhì)的抗原表位,結(jié)合氨基酸的變異信息,得到變異比較活躍的抗原表位
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