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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
對(duì)肝細(xì)胞癌與健康對(duì)照的外周血全基因表達(dá)譜進(jìn)行檢測(cè),分析篩選其差異表達(dá)基因。
材料與方法:
應(yīng)用Affymetrix基因芯片技術(shù)平臺(tái)的人類全基因表達(dá)譜芯片技術(shù),檢測(cè)15例臨床確診的肝細(xì)胞癌患者和15例年齡、性別等相匹配的健康人的外周血基因表達(dá)譜,利用Gene Spring11.0軟件采用t-test unequal unpaired算法,計(jì)算P<0.05時(shí)的差異表達(dá)基因并按差異倍數(shù)排序,利用Gene
2、Spring軟件及DAVID Bioinformatics Resources6.7對(duì)前期篩選的差異表達(dá)基因進(jìn)行聚類分析,GO分析和Pathway分析。
結(jié)果:
基因表達(dá)譜芯片分析發(fā)現(xiàn)597個(gè)有顯著差異表達(dá)的探針組(差異倍數(shù)≥2倍,P<0.05),共涉及434個(gè)基因,其中95個(gè)基因在肝癌患者外周血中表達(dá)顯著上調(diào),339個(gè)基因表達(dá)顯著下調(diào)。在肝癌患者中表達(dá)上調(diào)的基因主要與蛋白質(zhì)代謝過(guò)程、離子轉(zhuǎn)運(yùn)等生物學(xué)過(guò)程有關(guān),主要參
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