松落針病病原的快速分子檢測技術研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、松落針病是一種松樹上嚴重的葉部病害,自1927年朱美鳳首次報導馬尾松上由松針散斑殼(Lophodermium pinastri)引起的落針病以來,眾多學者普遍認為松針散斑殼(L.p)即松落針病的病原。本研究以二郎山松樹上的松針散斑殼(L.p)為研究對象,通過擴增病原菌核糖體ITS(internal transcribed spacer)基因區(qū)段,設計特異性引物,在落針病表現(xiàn)癥狀引起危害前,采用常規(guī)PCR方法擴增病原菌將其檢測出,為后續(xù)防

2、治工作提供依據(jù)。
   試驗前期于2008年7-8月在四川瀘定二郎山林場人工松林采集已經(jīng)發(fā)病的松針,采用子囊果組織分離法,分得松針散斑殼(L.p)作為供試菌株,并擴增其ITS區(qū)域,經(jīng)NCBI比對確認后,以此序列為標準設計特異引物。
   共設計特異性引物24對,篩選出最優(yōu)引物一條,編號5-3,序列為:
   F(5’-3’):5-AAGAATACAGGCTTCACG-318bp
   R(5’-3’):5

3、-GGTCAACCTTGTATGGTG-318bp
   本試驗共比較7種總DNA提取方法,包括核沉淀法、改良核沉淀法、二次沉淀法、CTAB法、高鹽低pH法、氯化芐法、尿素提取法,發(fā)現(xiàn)核沉淀法和改良核沉淀法提取總DNA后的擴增效果最佳。同時優(yōu)化了檢測體系的PCR反應條件,發(fā)現(xiàn)引物的最佳退火溫度應在50℃-54℃,引物濃度0.2μL(10mM),模板DNAlpL(約20-30ng)為反應的最佳濃度。
   在檢測過程中于2

4、009年3月之前都沒能檢測到松針散斑殼(L.p)存在,自2009年3月(包括3月)之后就能明顯的檢測到,但是只在松針的尖部和中部檢測到了松針散斑殼(L.p),在基部沒有發(fā)現(xiàn)。將每月經(jīng)瓊脂糖電泳檢測后的PCR產(chǎn)物(48個)和瓊脂糖膠回收產(chǎn)物(27個)送上海生工生物工程技術服務有限公司測序,測序結果經(jīng)NCBI比對均為松針散斑殼(L.p)。
   試驗結果表明利用病原菌的ITS區(qū)設計特異引物,用PCR的方法來檢測尚處于潛伏期的松針散斑

5、殼(L.p)行之有效,因為ITS區(qū)在種內不同菌株間高度保守而且存在著豐富的變化,足以針對某一種真菌設計特異引物,且由于特異性高,松樹和其他真菌的DNA不會隨著一起擴增,很容易在松樹發(fā)病前將其檢測出來。針對松針散斑殼(L.p),用本試驗方法在松樹發(fā)病前約兩個月的時候,特別是在松針看起來正常,剛出現(xiàn)褐色小斑點的時就能將其檢測出來,此時若集中燒毀松林內落地病針以減少初侵染源,并加強水肥管理輔以施用殺菌劑如石硫合劑、多菌靈等,便能很好的阻止松針

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