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1、近年來惡性腫瘤的發(fā)病率持續(xù)攀升,死亡率居高不下,對(duì)人類健康構(gòu)成了嚴(yán)重的威脅,攻克腫瘤已成為醫(yī)藥領(lǐng)域重點(diǎn)研究的課題之一。目前的研究思路是先確定合適的抗腫瘤靶點(diǎn),然后針對(duì)該靶點(diǎn)尋找高效低毒的抗腫瘤活性成分。
在眾多的抗腫瘤靶點(diǎn)中,細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的JAK激酶是研究比較熱門的靶點(diǎn)之一。JAK激酶包含了4個(gè)家族成員:JAK1蛋白、JAK2蛋白、JAK3蛋白和TYK2蛋白。基于該靶點(diǎn)上市的抗腫瘤藥物也不少,但大部分研究的JAK激酶抑制劑選擇
2、性不高,對(duì)蛋白的抑制作用不強(qiáng),也可能產(chǎn)生不少的毒性反應(yīng)。原因可能是對(duì)這些抑制劑分子具體的作用機(jī)制研究還不夠深入,很多JAK激酶抑制劑分子往往不能與相應(yīng)靶蛋白的活性位點(diǎn)在空間上完全匹配,因而不能發(fā)揮更強(qiáng)的生物效應(yīng),甚至產(chǎn)生一定的毒性。
基于此,本論文在參考文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上,利用分子對(duì)接的方法模擬了已上市或處在臨床研究中的11個(gè)JAK激酶抑制劑分子與4個(gè)JAK激酶家族成員蛋白的結(jié)合模式和相互作用,從分子水平探討了JAK激酶抑制劑分子對(duì)
3、靶蛋白產(chǎn)生抑制作用的主要機(jī)制,分析各抑制劑分子選擇性不高或活性低的原因,并對(duì)抑制劑分子可能的結(jié)構(gòu)修飾方向提出設(shè)想。
實(shí)驗(yàn)研究表明:JAK激酶家族的4個(gè)成員蛋白雖屬同一家族,但活性位點(diǎn)存在一定差異,每個(gè)活性位點(diǎn)均發(fā)揮相應(yīng)的生物效應(yīng),抑制劑分子只有占據(jù)活性腔中的所有結(jié)合位點(diǎn),才能表現(xiàn)出對(duì)該靶蛋白較強(qiáng)的結(jié)合能力和較強(qiáng)的抑制活性。
JAK1蛋白和JAK2蛋白的晶體結(jié)構(gòu)相似,活性位點(diǎn)均由P-loop區(qū)域、Hinge區(qū)域和A-l
4、oop區(qū)域構(gòu)成,抑制劑分子對(duì)這兩種蛋白的選擇性較差,結(jié)合能力相當(dāng);JAK3蛋白的活性區(qū)域是由富含甘氨酸的區(qū)域(Gly-loop)和“鉸鏈區(qū)”(Hinge region)構(gòu)成,抑制劑分子只有同時(shí)占據(jù)這兩個(gè)位點(diǎn)方能發(fā)揮最大的效應(yīng);TYK2蛋白活性位點(diǎn)是由一個(gè)large pocket和一個(gè)開放區(qū)域P-loop區(qū)域構(gòu)成,抑制劑分子只要牢牢占據(jù)這兩個(gè)位點(diǎn),均能發(fā)揮出很強(qiáng)的TYK2蛋白抑制活性。
通過對(duì)接構(gòu)象分析,我們發(fā)現(xiàn)類似平面結(jié)構(gòu)的多
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