CPA1、PRSS1基因突變檢測及其與慢性胰腺炎相關性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、慢性胰腺炎(chronic pancreatitis,CP)是一種胰腺實質性病變,最終可致胰腺內外分泌功能不全。我國CP發(fā)病率較低,但近年來有明顯上升的趨勢,因此明確CP發(fā)病機制將有助于對其進行早期診斷及治療。如今醫(yī)學、分子生物學和生物信息學等交叉學科不斷在發(fā)展,已有研究證實CP是由于環(huán)境因素和遺傳因素聯合作用所致。本研究包括兩部分內容,分別探討了四川地區(qū)漢族人群慢性胰腺炎CPA1和PRSS1基因突變情況以及CPA1和PRSS1基因與慢

2、性胰腺炎的相關性。
  本研究在中國四川地區(qū)漢族人群中篩查CPA1和PRSS1基因突變,并篩選CPA1和PRSS1基因上標簽SNPs位點,以探索CPA1和PRSS1基因與中國四川地區(qū)漢族人群CP發(fā)病的相關性。
  運用Sanger直接測序法進行CPA1和PRSS1基因全部外顯子區(qū)域目的片段的測序。將測序結果通過 UCSC數據庫進行在線比對并核準,同時將正常對照組的結果進行同步比對以明確突變的性質(SNP或新發(fā)現的突變),并通

3、過SIFT網站預測突變位點的性質,通過千人基因組計劃數據庫查詢突變位點是否為新發(fā)現突變。同時通過Haploview軟件挑選CPA1和 PRSS1基因上連鎖不平衡區(qū)域的標簽SNP,并用單堿基延伸法(SNaPshot)對上述位點基因型進行檢測,再通過 SPSS軟件分析其與CP的相關性。
  本研究在192例CP患者中,共發(fā)現CPA1和PRSS1基因突變7例,總突變率3.6%。其中發(fā)現3例CPA1基因突變(1.6%,3/192),突變分

4、別為c.281A>G、c.370A>G和c.1074C>T,4例PRSS1基因突變(2.1%,4/192),突變分別為c.44C>T、c.182C>T、c.365G>A和c.486T>C。有1例CP患者同時發(fā)生CPA1和PRSS1基因突變(0.5%,1/192),上述突變在正常對照組中均未發(fā)現。另外在CP組和對照組中均檢測到已報道的 SNPs位點,分別是位于 CPA1基因上的 rs537519042、rs1126899、rs559471

5、767、rs782588903和 rs34875501,位于 PRSS1基因上的 rs745538166和rs376671702。CPA1和PRSS1基因所選5處位點(rs7811409、rs7790688、rs11560388、rs741487和rs6667)基因分型結果均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(P>0.05);rs11560388位點AA基因型頻率在病例組和對照組中分別為8.9%、4.2%,風險等位基因 A等位

6、基因頻率分別為25.3%、17.3%,病例組均高于對照組(P<0.05);rs741487位點GG基因型頻率在病例組和對照組中分別為31.8%、24.6%,風險等位基因 G等位基因頻率分別為55.5%、46.5%,病例組均高于對照組(P<0.05);rs7811409、rs7790688和rs6667位點等位基因及基因型在兩組中比較差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05);進一步遺傳模型分析結果顯示,rs11560388位點在顯性模型[(AG

7、+AA) vs GG]和隱性模型[AA vs(AG+GG)]下病例組的患病風險分別是對照組的1.63倍、2.23倍;rs741487位點在顯性模型[(CG+GG) vs CC]中病例組的患病風險是對照組的1.76倍,在隱性模型中兩組分布差異無統(tǒng)計學意義。rs7811409、rs7790688及rs6667在兩組中遺傳模型分布差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
  首次在中國四川地區(qū)漢族人群中發(fā)現 CPA1和 PRSS1基因突變,

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