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文檔簡介
1、背景:博爾納病毒(BDV)是博爾納病的病原體,得名于一種地方性馬腦脊髓流行病,這種流行病爆發(fā)于19世紀末臨近德國薩克森城市博爾納鎮(zhèn)的馬匹中。BDV是一種嗜神經(jīng)、非細胞裂解、非分節(jié)段和歸類于單股反鏈病毒目的RNA病毒。BDV全基因組全長大約8.9kb,包含6個主要開放閱讀框。這種嗜神經(jīng) RNA病毒能感染包括人在內(nèi)的多種脊椎動物[1]。如今,BDV感染在包括中國[2,3]在內(nèi)的全球各地的多種動物感染[4]中被報道。感染的宿主廣泛的患有神經(jīng)紊
2、亂癥狀,從免疫介導性疾病到非炎癥的行為異常障礙[5]。新生感染大鼠會出現(xiàn)學習障礙、情感和行為異常。這種類似于人精神疾病的癥狀可作為因持續(xù)病毒感染引起人的大腦功能、形態(tài)學和行為的研究理想模型[6]。
BDV的致病機制尚且不完全清楚[7]。當研究BDV感染模型的分子生物學時,RT-qPCR是應用于基因表達的最普遍技術之一。篩選穩(wěn)定表達的內(nèi)參基因是正確評估基因表達的一個必要條件。
目的:本研究的目的在于從BDV感染的大鼠大
3、腦皮層神經(jīng)元中篩選出最穩(wěn)定的內(nèi)參基因。
方法:體外感染BDV的新生大鼠皮層神經(jīng)元中,在常用管家基因中運用標準RT-qPCR定量mRNA表達,篩選合適內(nèi)參基因。在培養(yǎng)正常神經(jīng)元和BDV感染的神經(jīng)元12天后,平行分析8個常用內(nèi)參基因的表達。內(nèi)參基因用 RT-qPCR驗證后通過4種統(tǒng)計方法 geNorm, NormFinder,BestKeeper,和△-Ct排序之后,運用RankAggregpackage生成最終排序結果。
4、 結果:四種統(tǒng)計方法產(chǎn)生不同的結果,geNorm排序 GAPDH&YWHAZ為第一穩(wěn)定的內(nèi)參基因,NormFinder和△-Ct排序 ACTB為第一, BestKeeper排序ppIA為第一。RankAggreg package最終確定ACTB為最穩(wěn)定的內(nèi)參基因。
結論:本研究首次通過在BDV感染的大鼠皮層神經(jīng)元中,運用PCR定量mRNA表達來篩選內(nèi)參基因。在神經(jīng)元感染BDV12天后,ACTB被定為最穩(wěn)定的內(nèi)參基因。通過這種
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