基于幾何特征的蛋白質結構相似性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、蛋白質功能與其空間結構密切相關。蛋白質三維結構相似性研究對蛋白質功能預測具有重要意義,因此己成為領域的研究熱點問題之一。蛋白質結構相似性研究通常從物理、化學、幾何或混合的角度進行研究。幾何特征是描述蛋白質三維結構的重要因素。本文從蛋白質結構劃分模式及統(tǒng)計方法、結構的多尺度特征、結構分布的幾何特性等方面對蛋白質結構的相似性開展了相關研究。主要工作如下:
   (1)對扇形劃分的特征提取方法進行深入研究,進一步考慮了扇形內部表面點的

2、分布及分布一致性問題,在此基礎上采用基于統(tǒng)計的方法改進了蛋白質結構扇形劃分模型的蛋白質結構相似性比較方法。實驗表明所提出方法的分類準確率優(yōu)于點個數(shù)特征提取方法,由此體現(xiàn)了扇形內部分布所對應的蛋白質結構細節(jié)對分類的意義,并初步證實了蛋白質結構的多尺度特性。
   (2)研究了蛋白質結構特征的多尺度問題。提出了一個基于小波變換的蛋白質結構多尺度的相似性比較方法。該方法首先把蛋白質映射到一維空間,然后應用小波變換實現(xiàn)結構的多尺度分解,

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