基于混合特征的蛋白質(zhì)形狀相似性分析.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩53頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1、蛋白質(zhì)相似性分析在生物學(xué)領(lǐng)域是一個備受關(guān)注的課題,通過研究蛋白質(zhì)問相似性可以幫助理解蛋白質(zhì)的功能和結(jié)構(gòu)。有很多基于蛋白質(zhì)三維模型的幾何特征來研究蛋白質(zhì)間相似性的方法,但是現(xiàn)有的一些蛋白質(zhì)模型相似性結(jié)果還有待提高。本文提出了一種基于三維蛋白質(zhì)模型混合特征來分析蛋白質(zhì)模型的相似性方法,主要研究工作如下:
  1.介紹了蛋白質(zhì)的不同結(jié)構(gòu)表示以及獲取蛋白質(zhì)三維網(wǎng)格模型的方法,并基于蛋白質(zhì)三維網(wǎng)格模型,計算了蛋白質(zhì)三維模型的曲率、形狀指數(shù)、

2、顯著幾何特征等局部表面特征描述符,分析了這些三維形狀特征描述符在蛋白質(zhì)分子的穩(wěn)定性分析、蛋白質(zhì)分子間的作用機制和三維蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)預(yù)測等方面的意義。
  2.為了能夠捕獲蛋白質(zhì)三維模型的拓撲結(jié)構(gòu)特征來彌補局部特征的不足,分析介紹了幾種三維形狀骨架提取算法,提出了一種簡單高效的蛋白質(zhì)三維模型骨架提取算法,并基于蛋白質(zhì)三維模型的骨架計算了局部直徑。計算蛋白質(zhì)三維模型的測地距離,并將測地距離替代歐式距離來改進熱核信號特征的計算。熱核信號

3、對形變具有魯棒性和等距等容變換不變性,能夠保留形狀的內(nèi)在幾何性質(zhì)。
  3.基于蛋白質(zhì)模型的顯著幾何特征(SGF)、局部直徑(LD)、以及熱核信號(HKS)構(gòu)造了蛋白質(zhì)三維模型的三階張量描述符。把基于矩陣的灰度關(guān)聯(lián)分析方法擴展到基于三階張量的灰度關(guān)聯(lián)分析方法,并對蛋白質(zhì)三維模型進行相似性分析。實驗結(jié)果表明,本文方法對具有復(fù)雜局部表面特征以及不同拓撲結(jié)構(gòu)特征的蛋白質(zhì)三維模型的相似性分析具有較好的適應(yīng)性和有效性。
  最后,對本

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論