1、四川大學碩士學位論文離散小波變換分析蛋白質(zhì)序列相似性姓名：王克龍申請學位級別：碩士專業(yè)：分析化學指導教師：李夢龍20040501四川大學硬士學位論文英文摘要A n a l y z i n g s i m i l a r i t yo f p r o t e i ns e q u e n c e s w i t hD i s c r e t e 舫v e l e t T r a n s f o r mM a j o r ：C h e m

2、o m e t r i c sG r a d u a t e s t u d e n t ：慚H 培K e I o n gA b s t r a c tT o f i n dt h e f u n c t i o n a ls i m i l a —t y o f p r o t e i n s w i t h l o w i d e n t i t yi sah i n g e o fp r o t e i ns e q u e n

3、c e a n a l y s i s ．W a v e l e tt r a n s f o r ms h o w st h ea d v a n t a g ei nf i n d i n g t h e h o m o l o g yp r o t e i n s w i t h l o ws i m l l a d t y , e s p e c i a l l yw h o s ei d e n t i t y i S I o

4、 w e rt h a n2 5 ％．1 no r d e rt os t a n d a r d i z et h i s m e t h o d 。f i v ef a c t o r so fa n a l y z i n gt h es i m i l a r i t yo fp r o t e i ns e q u e n c e sw i t hd i s c r e t ew a v e l e tt r a n s f

5、o r m ( D V 盯) w e r ed i s c u s s e d - i n c l u d i n g t h es u b s t i t u t i o nm o d e l Jt h ew a v e l e t s ，t h ed e c o m p o s i t i o nl e v e l s ，t h ec o m p a d n gm e t h o d ，a n dt h e e v a l u a

6、t i o n o fs i m i l a d t y ．( i ) I n t h i s p a p e r ，t h r e e s u b s t i t u t i o nm o d e l s w e r ec o m p a r e d ．( i i ) T h e b e R e r w a v e l e t sa n d t h ed e c o m p o s i t i o nl e v e l f i t t

7、 i n g f o r a n a l y z i n g p r o t e i n s e q u e n c e sw e r es t u d i e d ．( i i i J T h eI e n g t ho f s e q u e n c e s a f f e c t st h er e s u l tm o r e t h a nt h ed e g r e eo f i d e n t i t yw h e n u

8、 s i n gD v v 下t oa n a l y z e t h es i m i l a r i t yo f t w o p r o t e i ns e q u e n c e s ．T om i n i m i z e t h e e f f e c t s o f t h e s e q u e n c e l e n g t h ，t h e s e g m e n t a t i o nc o m p a r i n

9、 g m e t h o d w a s d e s i g n e d ．T h e r e s u l t s i n d i c a t e t h a t t h es e g m e n t a t i o n s t r a t e g y h a s g r e a t l y i m p r o v e d t h e p e r f o r m a n c e o fa n a l y z i n gt h el o