饑餓誘導(dǎo)渦蟲(chóng)差異表達(dá)基因的篩選及九產(chǎn)地淡水渦蟲(chóng)Hsp70親緣關(guān)系分析.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:采用mRNA差異顯示反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù)(DDRT-PCR)篩選塔崗水庫(kù)淡水渦蟲(chóng)饑餓誘導(dǎo)中的差異表達(dá)序列標(biāo)簽(Express sequence tags,ESTs),探索淡水渦蟲(chóng)抗饑餓生存的分子機(jī)理;對(duì)九產(chǎn)地淡水渦蟲(chóng)的Hsp70序列進(jìn)行分子系統(tǒng)學(xué)研究,對(duì)其系統(tǒng)演化關(guān)系進(jìn)行了初步探討。 方法:饑餓誘導(dǎo)塔崗水庫(kù)的淡水渦蟲(chóng),在饑餓一個(gè)月時(shí)將其處死,提取總RNA,用mRNA差異顯示技術(shù)(DDRT-PCR)研究饑餓情況下差異表達(dá)

2、的基因,克隆與測(cè)序后用生物信息學(xué)方法對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析;克隆九產(chǎn)地淡水渦蟲(chóng)Hsp70基因序列,進(jìn)行分子系統(tǒng)學(xué)分析。 結(jié)果:運(yùn)用mRNA差別顯示技術(shù)篩選饑餓渦蟲(chóng)體內(nèi)的差別表達(dá)基因,獲得18條差異表達(dá)片段。6個(gè)為18srRNA,2個(gè)為28srRNA,1個(gè)為翻譯起始因子,1個(gè)為與日本三角渦蟲(chóng)信使mRNA上與DjClg3表達(dá)有關(guān)的CaspaSe-3基因,1個(gè)與日本三角渦蟲(chóng)DEAD box蛋白表達(dá)有關(guān)的信使mRNA同源序列,1個(gè)與Hsp7

3、0基因同源,1個(gè)與Hsp90基因同源,2個(gè)與Polaromonas藻JS666的基因組序列同源性最高,1個(gè)與Schmidtea mediterranea克隆H.67.8d的未知mRNA序列同源性最高,還有2個(gè)在Genbank中未找到同源序列。此外,我們還克隆了九個(gè)產(chǎn)地渦蟲(chóng)的Hsp70部分cDNA序列,并用分子進(jìn)化分析軟件Meg3.1軟件對(duì)其分析構(gòu)樹(shù)。九產(chǎn)地渦蟲(chóng)Hsp70親緣關(guān)系顯示:信陽(yáng)新縣農(nóng)科所、信陽(yáng)寨溝和信陽(yáng)息縣陳灣大橋下三地聚類(lèi)一

4、枝,親緣關(guān)系較近;南陽(yáng)淮源寺和南陽(yáng)桐柏均屬桐柏山區(qū),聚為一個(gè)小枝;山西王莽嶺西部河錫崖村和山西王莽嶺錫崖溝下兩個(gè)產(chǎn)地同在王莽嶺風(fēng)景區(qū)內(nèi),地理位置及環(huán)境都非常相似,聚為一個(gè)小枝:新鄉(xiāng)衛(wèi)輝塔崗水庫(kù)屬太行山區(qū),但與王莽嶺兩地距離關(guān)系而言,相對(duì)較遠(yuǎn),因此獨(dú)立為一枝;洛陽(yáng)白云山屬伏牛山系,地理位置上與前八個(gè)產(chǎn)地相對(duì)比較遠(yuǎn),親緣關(guān)系較遠(yuǎn),故也單獨(dú)為一枝。 結(jié)論:初步篩選出18個(gè)饑餓誘導(dǎo)的差異表達(dá)ESTs,為功能基因的克隆與分析奠定了基礎(chǔ)。九

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