1、隨著系統(tǒng)生物學的迅猛發(fā)展，各類不同生化動力學網(wǎng)絡逐漸被人們所認識和重視(如代謝控制網(wǎng)絡、基因調控網(wǎng)絡及信號轉導網(wǎng)絡等)。然而這些網(wǎng)絡的復雜性使得人們難以從實驗方面直觀了解其功能和作用機制。為較好地認識這些網(wǎng)絡的拓撲結構及動力學過程，計算機模擬技術被應用于生化網(wǎng)絡體系的研究。 論文第一章主要介紹了計算機模擬技術的概況以及將其應用于生化動力學網(wǎng)絡的優(yōu)點和意義。 第二章詳細討論了現(xiàn)有的各類模擬算法和模擬軟件。內容包括對國際上

2、常用的模擬算法和模擬軟件分類和總結，并針對已有軟件的不足，介紹了自編的模擬軟件CSU。同時，還就如何根據(jù)實際體系選擇合適的模擬算法和模擬軟件一問題給出討論。 第三章對不同的生化網(wǎng)絡模型進行研究。對同一生化動力學網(wǎng)絡，可分別用隨機性模型和確定性模型來描述。該章以一生物節(jié)律網(wǎng)絡體系為例，從不同角度比較了兩種模型的模擬結果，同時還從原理上揭示了兩種模型的適用范圍。 第四章在計算機模擬技術的基礎上，將均勻設計方法運用于生物節(jié)