富集文庫法開發(fā)谷子的微衛(wèi)星分子標(biāo)記.pdf_第1頁
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1、河北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文富集文庫法開發(fā)谷子的微衛(wèi)星分子標(biāo)記姓名:李琳申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):微生物學(xué)指導(dǎo)教師:刁現(xiàn)民趙寶華20080520個(gè)谷子和8個(gè)青狗尾草品種檢測(cè)它們的多態(tài)性信息,結(jié)果在篩選出的22對(duì)(564%)多態(tài)性引物中共檢測(cè)到185個(gè)等位基因,每對(duì)引物平均為841個(gè);其中引物GTDZ773和AGDZ2341檢測(cè)到的等位基因最多(16個(gè)),最少的AGDZ2310中檢測(cè)到2個(gè),其PIC值分別為09l、0。90和O37,22對(duì)引物平

2、均PIC值為O76,顯示出較高的位點(diǎn)變異頻率,說明所開發(fā)的SSR標(biāo)記適用于谷子和狗尾草屬遺傳學(xué)研究。利用多態(tài)性SSR引物在28份狗尾草屬不同種和品種間擴(kuò)增,統(tǒng)計(jì)各標(biāo)記的等位基因頻率分布,22個(gè)多態(tài)性引物總共檢測(cè)到221個(gè)等位基因,不同品種間變異范圍為2~22個(gè),平均1005個(gè);平均PIC值為078,變異范圍在037~093之間。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),SSR標(biāo)記在谷子、青狗尾草及其它種狗尾草中的多樣性表現(xiàn)不同,三者中發(fā)現(xiàn)的等位基因數(shù)分別為138

3、、175和194個(gè),分別占總數(shù)(221)的624%、792%和878%,而且青狗尾草品種平均PIC值(O73)高于谷子品種(072),證明谷子間的遺傳差異低于野生青狗尾草;同時(shí)數(shù)據(jù)對(duì)比表明,青狗尾草與谷子間的親緣關(guān)系比其它種狗尾草近。根據(jù)這22個(gè)標(biāo)江卉谷子及近緣野生種的變異數(shù)據(jù),計(jì)算各基因型的遺傳相似系數(shù),根據(jù)SM系數(shù)進(jìn)行聚類分析,采用uPC、fA法構(gòu)建狗尾草屬遺傳進(jìn)化關(guān)系圖,結(jié)果表明:所用22個(gè)SSR標(biāo)記即可將28份材料清晰分為2大類

4、群(青狗尾草類群和金色狗尾草類群),3個(gè)小組(谷子、青狗尾草、金色狗尾草),而且谷子與青狗尾草之間的遺傳距離小于與其它種的遺傳距離,進(jìn)一步證實(shí)了谷子起源于青狗尾草的觀點(diǎn);谷子相對(duì)緊密的聚在一起,且其間的遺傳差異明顯小于狗尾草,證明谷子在進(jìn)化中發(fā)生遺傳變異的幾率相對(duì)狗尾草較低,表明其基因組的相對(duì)保守性;而通過對(duì)2大類群間差異的分析得出,金色狗尾草類群可能早于谷子和狗尾草分化之前就已經(jīng)與它們分開,從一定程度上揭示了狗尾草屬基因組進(jìn)化情況。本

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