坦布蘇病毒的分離鑒定重組腺病毒介導(dǎo)shRNA抑制坦布蘇病毒在體外復(fù)制的研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩115頁未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1、坦布蘇病毒(Tembusu virus,TMUV)是導(dǎo)致肉鴨神經(jīng)癥狀及產(chǎn)蛋鴨出血性卵巢炎(duck hemorrhagic ovaritis,DHO)的主要病原,主要引起20日齡以內(nèi)的雛鴨出現(xiàn)嚴(yán)重的神經(jīng)癥狀,死淘率增高及產(chǎn)蛋鴨的產(chǎn)蛋大幅下降。發(fā)病雛鴨通常表現(xiàn)為采食量下降,腹瀉,共濟(jì)失調(diào),癱瘓等癥狀。發(fā)病蛋鴨體溫升高;四肢無力、癱瘓;食欲廢絕;發(fā)病后不久開始產(chǎn)蛋大幅下降;發(fā)病后期排草綠色稀便,氣味惡臭,出現(xiàn)神經(jīng)癥狀。剖檢可見卵泡破裂出血,

2、卵黃性腹膜炎,脾臟出血,胰腺出血壞死,肝臟腫大、出血。
   TMUV屬于黃病毒科黃病毒屬蚊媒病毒類的恩塔亞病毒群,是一種具有包膜的單股正鏈RNA病毒,通過節(jié)肢動物的叮咬進(jìn)行傳播而導(dǎo)致宿主發(fā)病。病毒的基因組全長約為11kb,包含5'和3'的非編碼區(qū),僅含有一個開放閱讀框(Open reading frame,ORF),編碼3種結(jié)構(gòu)蛋白和8種非結(jié)構(gòu)蛋白。其中包膜蛋白(Envelop protein,E)蛋白是病毒的主要結(jié)構(gòu)蛋白,與

3、病毒的吸附,融合,注入,血凝性及宿主范圍和細(xì)胞嗜性有密切關(guān)系;NS5蛋白為TMUV分子量最大的蛋白,也是最保守的蛋白,它具有RNA依賴的RNA聚合酶活性,與病毒基因組的復(fù)制密切相關(guān)。在本研究中我們利用建立的多種TMUV核酸檢測方法應(yīng)來確定TMUV感染的宿主范圍,以闡明該疾病的流行特點(diǎn)。并利用腺病毒介導(dǎo)shRNA技術(shù)靶向干擾E基因和NS5基因,探索TMUV防治的新策略,為我國有效防治該病奠定基礎(chǔ)。
   1.TMUV的半套式RT-

4、PCR檢測方法的建立
   根據(jù)與TMUV同源性較高的Bagaza病毒的NS3基因的保守序列設(shè)計了3條引物,建立了一種適用于TMUV檢測的半套式RT-PCR快速檢測方法。采用該方法對TMUV山東分離株進(jìn)行檢測。結(jié)果顯示,半套式RT-PCR對兩株分離株均能擴(kuò)增出277bp的特異性條帶,而對照病原:鴨瘟病毒、禽流感病毒(H9亞型)、新城疫病毒、傳染性法氏囊病病毒、減蛋綜合癥病毒、擴(kuò)增結(jié)果均為陰性;敏感性試驗(yàn)結(jié)果顯示第一輪擴(kuò)增的敏感度

5、1×105copies/μL,第二輪擴(kuò)增的敏感度為1×102copies/μL,第二次擴(kuò)增的敏感性比第一次高103倍;該方法對山東省各地采集的24份疑似病料的檢測出率可達(dá)87.5%。表明本試驗(yàn)所建立的套式PCR方法可用于TMUV感染的臨床診斷和流行病學(xué)調(diào)查。
   2.TMUV的RT-LAMP檢測方法的建立及四種核酸檢測方的比較
   根據(jù)TMUV的NS5基因的保守序列設(shè)計一套引物,建立了一種適用于TMUV的逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)

6、等溫擴(kuò)增快速檢測方法。該方法檢測的敏感性可達(dá)1×101拷貝/μL;對3株 TMUV山東分離株的檢測均為陽性,而對鴨瘟病毒、禽流感病毒(H9亞型)、新城疫病毒、傳染性法氏囊病病毒、減蛋綜合征病毒、擴(kuò)增結(jié)果均為陰性;應(yīng)用該方法對山東省各地采集的76份疑似病料可檢出68份陽性。表明本試驗(yàn)所建立的環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增檢測方法簡便、快速、靈敏、特異性高,可用于TMUV感染的臨床診斷和流行病學(xué)調(diào)查。
   利用針對TMUV的NS5基因建立的RT-

7、PCR,半套式RT-PCR,熒光定量RT-PCR及RT-LAMP四種檢測方法對系列稀釋的質(zhì)粒DNA以及TMUV基因組RNA進(jìn)行檢測,評價4種檢測方法的檢測敏感度。結(jié)果顯示四種檢測方法的質(zhì)粒檢測敏感度分別為2×104拷貝/μL,20拷貝/μL,2拷貝/μL和20拷貝/μL,基因組RNA的檢測敏感度分別為100pg,100fg,10fg和100fg。在針對采自疑似TMUV感染的鴨場的69份泄殖腔棉拭子的檢測中,四種檢測方法的檢出率分別為38

8、/69(55.1%),52/69(75.4%),57/69(82.6%)和55/69(79.7%)。綜上所述,四中核酸檢測方法中RT-LAMP以其在敏感度,特異性及檢測時間等方面的優(yōu)勢,作為TMUV檢測中的首選檢測方法。
   3.不同宿主來源的TMUV的分離鑒定
   為研究TMUV的自然感染宿主范圍及流行特點(diǎn),我們從山東省各地采集麻雀樣品68份,蚊子樣品35組,蛋雞樣品73份,蛋鴨樣品132份和雛鴨樣品112份,應(yīng)用

9、建立的半套式RT-PCR進(jìn)行TMUV的檢測,并對陽性樣品進(jìn)行分離鑒定。結(jié)果顯示5種樣品的檢出率分別為66%(45/68),60%(21/35),33%(24/73),62%(82/132)和69%(77/112)。對每類樣品選取一株分離株進(jìn)行NS5基因的序列分析,結(jié)果5株分離株的NS5基因同源性高達(dá)99.5%以上。代表毒株TMUV-SDHS與經(jīng)典毒株YY5,BYD的相應(yīng)基因的同源性在99%以上,與TMUV國外分離株的同源性在87%-91

10、%之間。攻毒試驗(yàn)顯示TMUV-SDHS及TMUV-SDMS可以引起55周齡的櫻桃谷鴨種鴨發(fā)病且臨床癥狀與剖檢變化與自然感染病例一致。以上結(jié)果表明山東省TMUV感染現(xiàn)象已經(jīng)十分普遍;山東省不同宿主來源的TMUV分離毒株為同一種病毒;TMUV不僅可以感染產(chǎn)蛋鴨及雛鴨也可以感染蛋雞和麻雀,但無明顯癥狀;麻雀及蚊子可攜帶TMUV并與TMUV在自然界中的傳播有著密切的關(guān)系;麻雀攜帶TMUV與該病毒在冬季仍然流行有著密切關(guān)系。
   4.T

11、MUV山東分離株全基因序列的測定及分析
   從山東濰坊發(fā)生產(chǎn)蛋下降的鴨群中分離到一株TMUV(SD1001),應(yīng)用RT-PCR及RACE技術(shù)對該分離株的全基因序列進(jìn)行測定并對獲得的序列進(jìn)行分析。結(jié)果顯示該TMUV分離株為單股正鏈RNA病毒,基因組全長10990nt,僅含有一個獨(dú)立的開放閱讀框(Open reading frame,ORF),編碼3410個氨基酸?;蚪M兩端分別為5'和3'非編碼區(qū),長度分別為142nt和618n

12、t。病毒基因組共編碼11種蛋白,其中3種結(jié)構(gòu)蛋白,8種非結(jié)構(gòu)蛋白。通過將各編碼蛋白的氨基酸序列與JEV、WNV、YFV、DEN2V、BAGV、TBEV的相應(yīng)序列進(jìn)行比較,結(jié)果TMUV與BAGV的氨基酸同源性最高(81.4%),與TBEV的同源性最低(41.8%)。同時TUMV的非編碼區(qū)序列與BAGV具有高度的一致性,包含多個保守區(qū)域(conserved sequences,CS),CS序列為RCS3-CS3-RCS2-CS2-CS1。以

13、上研究結(jié)果為研究病毒宿主特點(diǎn)及組織嗜性提供了有力的數(shù)據(jù)支持。
   5.腺病毒介導(dǎo)shRNA在體內(nèi)外抑制TMUV復(fù)制研究.
   RNA干擾(RNA interference,RNAi),又稱RNA沉默,是指雙鏈RNA特異性誘導(dǎo)mRNA降解的過程,是一種轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)沉默(post transcripitional gene silence,PTGS)現(xiàn)象。近年來RNAi在疾病治療領(lǐng)域展現(xiàn)出極大的潛力,特別是抗病毒治療等

14、方面。
   (1)靶向干擾TMUV E基因和NS5基因shRNA序列的篩選
   本研究針對TMUV的E和NS5基因分別設(shè)計構(gòu)建了三個特異性shRNA(short hairpinRNAs)表達(dá)載體pSilencer-E1、pSilencer-E2、pSilencer-E3及pSilencer-NS51、pSilencer-NS52、pSilencer-NS53。用RT-PCR擴(kuò)增TMUV的E、NS5部分基因,純化后將二

15、者分別克隆到pEGFP-N1載體中,構(gòu)建熒光報告重組質(zhì)粒pEGFP-E和pEGFP-NS5。干擾載體和目的基因報告載體共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞后的檢測結(jié)果表明,6個干擾載體均不同程度的干擾了目的基因的表達(dá),其中pSilencer-E1及pSilencer-NS52的抑制效果最佳,分別為75.8%和68.7%。將六種的shRNA表達(dá)載體分別轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,轉(zhuǎn)染24h后接種TMUV病毒,接種后48h應(yīng)用相對定量熒光RT-PCR上述試驗(yàn)中病毒RN

16、A的相對數(shù)量。結(jié)果顯示兩種干擾載體都能有效干擾病毒在細(xì)胞中的復(fù)制,抑制效率分別為74%及86%,因此選擇pSilencer-NS52用于進(jìn)一步研究。
   (2)干擾TMUV復(fù)制的重組腺病毒的構(gòu)建與鑒定
   表達(dá)shRNA-NS52的腺病毒載體的構(gòu)建采用AdMax載體系統(tǒng),將shRNA-NS52表達(dá)盒從pSilencer-NS52轉(zhuǎn)移到腺病毒穿梭載體pDC312上,構(gòu)建重組穿梭載體pDC312-NS52。將腺病毒骨架質(zhì)

17、粒pBHGloxΔE1與pDC312-NS52穿梭質(zhì)粒按1∶3比例共轉(zhuǎn)染HEK293細(xì)胞,進(jìn)行同源重組,成功產(chǎn)生重組腺病毒pAd-NS52并通過HEK293細(xì)胞多次擴(kuò)增后測定重組病毒滴度分別為2.1×109pFU/ml.
   (3)重組腺病毒介導(dǎo)的shRNA抑制TMUV在HEK293細(xì)胞中復(fù)制的研究
   為評價重組腺病毒pAd-NS52對TMUV的體外干擾效果。將重組病毒pAd-NS52接種HEK293細(xì)胞,24h后

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論