鴨甲肝病毒3型山東分離株的分離鑒定及VP1基因的序列分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、鴨病毒性肝炎是雛鴨一種急性和高度致死性傳染病,主要感染1~3周齡雛鴨,死亡率高達(dá)90%以上。目前該病已成為影響世界水禽養(yǎng)殖業(yè)的重要疫病之一。DHAV可分為基因A型、B型和C型,相當(dāng)于歷史上所稱的DHV-1、2007年發(fā)現(xiàn)于臺灣的DHV“臺灣新型”和2007發(fā)現(xiàn)于韓國的DHV“韓國新型”。由于這三個基因型病毒之間的交叉保護(hù)力很差,所以將這三個基因型分別對應(yīng)于三個血清型,即DHAV-1型、DHAV-2型和DHAV-3型。本研究主要分為三部分

2、:
   第一部分14株DHAV-3的病毒分離和PT-PCR鑒定
   采集2012年來自山東省濟(jì)南、濰坊、煙臺三個不同地區(qū)的50份病死鴨肝組織。病料研磨處理后,分別經(jīng)尿囊腔接種11日齡鴨胚,收獲45份死亡鴨胚尿囊液。收獲的每份尿囊液分別經(jīng)腿部肌肉注射接種2~3日齡的健康雛鴨5只,0.2mL/只。結(jié)果接種24小時后雛鴨開始出現(xiàn)死亡,病死鴨均呈現(xiàn)典型的鴨甲肝病毒性肝炎的臨床癥狀和病理變化。根據(jù)已公布的DHAV-3的核酸序列

3、設(shè)計引物對分離病毒進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果表明自山東省分離到14株DHAV-3。
   第二部分鴨甲肝病毒3型山東分離株VP1基因的序列分析
   本研究對2011-2012年從山東省分離到的14株DHAV-3的VP1基因分別進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增、序列測定與分析。結(jié)果顯示,14株DHAV-3的VP1基因均由720個核苷酸組成,共編碼240個氨基酸,核苷酸序列和氨基酸序列同源性分別為94.6%~99.9%和95.0%~1

4、00%。與GenBank中已經(jīng)公布的31株DHAV-3的VP1基因的核苷酸和氨基酸的同源性分別為92.5%~100%和90.8%~100%。進(jìn)化樹分析顯示,DHAV-3的VP1基因具有明顯的地域特征。所有毒株據(jù)此分為兩個基因型:GⅠ型和GⅡ型,其中GⅡ型又分為S1和S2兩個亞型。所有中國分離野毒株均屬于GⅠ型,越南分離野毒株主要屬于GⅡ型S1亞型,而所有韓國分離株組成GⅡ型中的S2亞型。
   第三部分 SD1101株DHAV-

5、3的病毒的全基因組測序及序列分析
   根據(jù)已發(fā)表的DHAV-3型的病毒的全基因組序列設(shè)計特異性的引物,采用RT-PCR法對SD1101株DHAV-3的基因組全序列進(jìn)行了分子克隆與測序,研究結(jié)果表明,SD1101株的基因組結(jié)構(gòu)為5'UTR-VP0-VP3-VP1-2A1-2A2-2B-2C-3A-3B-3C-3D-3'UTR,符合小核糖核酸病毒科基因組的基本結(jié)構(gòu)?;蚪M全長為7794個核苷酸殘基,包括652個核苷酸殘基的5'端非

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