高脂誘導(dǎo)胰島素抵抗大鼠的肝臟基因表達(dá)譜、粗提線粒體蛋白質(zhì)組、MiRNAs的初步研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:
   1.建立高脂誘導(dǎo)胰島素抵抗的大鼠模型。
   2.初步篩選出肝臟可能參與胰島素抵抗發(fā)生的mRNA、蛋白(粗提線粒體)、miRNAs,為后續(xù)工作準(zhǔn)備。
   3.進(jìn)一步了解胰島素抵抗的形成機(jī)制,并為診斷、治療和改善胰島素抵抗提供的潛在靶點(diǎn)。
   方法:
   1.實(shí)驗(yàn)動物:13只雄性SD大鼠(普食組6只,高脂組7只),4-5w,130g左右;高脂配方:基礎(chǔ)飼料80%,豬油18%,膽固

2、醇2%。監(jiān)測體重,根據(jù)HOME-IRI、GTTs、ITTs判斷系統(tǒng)胰島素抵抗形成后處理大鼠,觀察肝臟外觀、稱其濕重,進(jìn)行血清基礎(chǔ)生化、游離脂肪酸譜檢測,肝臟透射電鏡、線粒體拷貝數(shù)、能量指標(biāo)、ROS檢測。
   2.肝臟基因表達(dá)譜:肝臟總RNA提取后行mRNA表達(dá)譜芯片檢測(IlluminaRatRef12Beadchip),結(jié)果行KEGG分析。
   3.肝臟粗提線粒體蛋白質(zhì)組:租提肝臟線粒體蛋白,2-D分析找差異蛋白,

3、挖取做MALDI-TOF質(zhì)譜分析,然后Mascot軟件分析,數(shù)據(jù)再KOG分類。
   4.肝臟miRNAs:肝臟總RNA提取后行miRNA的IlluminaSolexa測序、結(jié)果使用Mirtools軟件分析,對差異miRNAs用real-timePCR進(jìn)行驗(yàn)證,后用miRDB軟件進(jìn)行靶基因預(yù)測。
   5.對差異mRNA、蛋白質(zhì)、miRNAs進(jìn)行綜合分析。
   結(jié)果:
   1.第12周時,HOME-I

4、RI、GTTs、ITTs結(jié)果提示系統(tǒng)胰島素抵抗形成,此時表現(xiàn)為肥胖,脂肪肝,肝濕重增加,血脂紊亂,血清游離脂肪酸譜異常,電鏡顯示肝細(xì)胞內(nèi)大量脂滴堆積、線粒體腫脹、胞核被擠壓或固縮、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)增生,線粒體拷貝數(shù)明顯降低,ROS明顯升高,能量指標(biāo)無明顯變化。
   2.對提取合格的肝臟總RNA用含24000個探針的大鼠全基因組芯片檢測,經(jīng)校正和差異分析后獲得1756個差異基因,進(jìn)一步采用FDR后還有502個,顯著上調(diào)的290個,顯著下調(diào)

5、的212個。再經(jīng)KEGG通路分析,發(fā)現(xiàn)物質(zhì)代謝、炎癥免疫通路、氧化/抗氧化系統(tǒng)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、細(xì)胞骨架等的變化。
   3.對粗提的肝臟線粒體蛋白行2-D分析,分離到的蛋白點(diǎn)數(shù)普食組1012±45.53,高脂組1029.67±42.72個,差異點(diǎn)128個;取其中105個做MALDI-TOF質(zhì)譜分析,數(shù)據(jù)經(jīng)搜庫及分析整理,最終確定24個差異蛋白,即和普食組相比,高脂組中顯著上調(diào)的9個蛋白,顯著下調(diào)的15個蛋白;KOG分類發(fā)

6、現(xiàn)它們主要參與生物代謝、細(xì)胞生命過程及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等。
   4.對提取合格的肝臟總RNA用Solexa法對其miRNAs進(jìn)行測序,結(jié)果行Mirtools數(shù)據(jù)分析,獲得的已知miRNAs中普食組236個,高脂組239個,未知miRNAs中普食組22個,高脂組141個,差異miRNAs10個。對差異miRNAs進(jìn)行相對定量PCR,獲1.5倍以上差異的miRNAs8個,用miRDB軟件進(jìn)行靶基因預(yù)測發(fā)現(xiàn)一些炎癥、糖利用、細(xì)胞分化等相關(guān)的

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