菜豆普通細菌性疫病抗性基因精細定位與候選基因分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、普通菜豆是人類直接消費的最重要食用豆類之一。生產(chǎn)上,菜豆普通細菌性疫病對普通菜豆的危害越來越重,需要不斷挖掘抗性基因,培育新型抗性品種代替現(xiàn)有品種。本研究基于前期大規(guī)模資源篩選結果,對HR45和龍蕓豆5號攜帶的抗性基因進行精細定位并分析候選基因,獲得如下主要結果:
  1、HR45抗病遺傳分析
  采用針刺法利用Xap菌對F1、F2及F23家系進行接種鑒定。14與21DAI,正交雜交種F1的發(fā)病級分別是4.27與4.67,反

2、交發(fā)病級別與正交基本一致,為4.33與4.73,說明HR45抗性為細胞核遺傳;F1代發(fā)病級別位于抗感親本之間,說明由不完全顯性基因控制。
  F2群體抗感分離明顯且呈連續(xù)分布,說明HR45抗性為數(shù)量性狀。利用F2∶3家系表型推測對應F2單株基因型,抗感分離不符合基因分離定律,說明HR45中至少含2個抗性基因。
  2、HR45抗病基因初定位
  利用均勻分布于普通菜豆11條染色體上的2,802個SSR標記對親本進行多態(tài)

3、性篩選,獲得537個多態(tài)性標記,利用這些標記進一步篩選由F2單株組成的極端抗、感池,在染色體Pv06與Pv08上獲得多態(tài)性標記,說明抗性基因位于Pv06與/或Pv08上。
  結合F2群體表型檢測抗病位點,在Pv06與Pv08上檢測到抗病位點。Pv06上抗病基因位于SSR標記p6s53與p8s243之間;在Pv08上共檢測到2個抗病基因,位于標記p8s189與p8b24之間和p8b27與p8b28之間,相距約為8.5kb。

4、  3、HR45抗病基因精細定位
  針對初定位候選區(qū)段,共開發(fā)74個SSR和125個In/Del標記,其中44個標記在親本間有多態(tài)。利用多態(tài)性標記構建遺傳圖譜并結合群體表型定位抗病基因,14與21DAI在Pv06與Pv08上都檢測到抗病位點,命名為qH6與qH8。
  qH6位于Pv06染色體SSR標記p6s260與p8s243之間,標記間物理距離為326kb,14與21DAI的LOD值分別為7.8和12.2、貢獻率分別為

5、6.4%與7.5%。qH8位于標記p8s433與p8b17之間,標記間物理距離為18.5kb,14與21DAI的LOD值分別為15.5與16.1、貢獻率分別為46.6%與39.9%,該位點效應值較大,共預測到3個基因。Gene1編碼AAA-type ATPase、Gene2編碼PPR、Gene3編碼anthocyanidin3-O-glucosyltransferase1-like蛋白。
  4、HR45抗病候選基因分析
 

6、 對3個候選基因在抗感材料中進行克隆、比對和結構預測。Gene1屬于UBA like家族,Gene2屬于PPR超家族,Gene3屬于UDPGT家族;抗感材料中Gene2、Gene3的CDS、啟動子序列均存在差異。利用RT-PCR技術分析候選基因表達模式,抗感材料中Gene1表達量基本一致,抗病材料中Gene2表達量略低于感病材料,而Gene3略高于感病材料。
  抗感材料中3個候選基因表達均受病原菌誘導,其中Gene3表達量在接種

7、48h后抗病材料高于感病材料。VIGS檢測結果表明Gene3可能是HR45的抗病候選基因。
  5、源于龍蕓豆5號的抗性基因定位
  龍蕓豆5號對Xff菌表現(xiàn)良好抗性。為明確其抗性基因,與感病材料雜交構建F2群體。14與21DAI,同時在Pv10上檢測到抗病位點,LOD值分別為6.41與5.35,位于SSR標記p10s174與p10s244之間,標記間物理距離為270kb,其中10個預測基因編碼的激酶、氧化酶和轉(zhuǎn)錄因子等可能

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