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文檔簡介
1、水稻(Oryza sativa)在亞洲乃至全世界都是主要的糧食作物之一。隨著生活水平的不斷提高,人們越來越重視稻米的外觀性狀。水稻粒形不僅是稻米外觀指標(biāo)之一,也是產(chǎn)量構(gòu)成的重要因素之一,然而同時改良水稻的產(chǎn)量和品質(zhì)對育種家來說是很大的挑戰(zhàn),因為產(chǎn)量和品質(zhì)性狀通常是負(fù)相關(guān)的。在過去的十幾年中,人們對粒形的遺傳機(jī)理做了廣泛的研究,但是其中的遺傳基礎(chǔ)還不清楚。因此深入解析稻米粒形的遺傳基礎(chǔ)將對培育高產(chǎn)的水稻品種具有重要指導(dǎo)意義。
染
2、色體片段置換系(Chromosome segments substitution lines,CSSLs)屬于永久性群體,相對于F2等臨時性群體,可以滿足重復(fù)實驗的需求,同時能夠有效地排除遺傳背景的影響,很適合遺傳基礎(chǔ)的研究。本研究以粳稻Asominori和秈稻IR24雜交衍生的兩套交互式染色體片段置換系(CSSLs)以及分別與背景親本雜交產(chǎn)生的兩套F1群體,共四套群體為實驗材料,利用SSR標(biāo)記構(gòu)建了兩套置換系的基因型圖譜。結(jié)合粒形的表
3、型數(shù)據(jù),利用Icimapping軟件分析了各個群體中加-顯性QTL位點,同時利用中親優(yōu)勢值分析了F1群體中的雜種優(yōu)勢位點(Heterotic loci,HL)。主要結(jié)果如下:
1.SSR基因型圖譜構(gòu)建:利用131對SSR標(biāo)記對以Asominori為受體,以IR24為供體的NAIS置換系構(gòu)建基因型圖譜;在粳稻置換系中,9%的家系為單片段置換系,50%的家系包含2-3個供體片段,28%的家系包含4-5個供體片段,大于6個供體片段的
4、家系(主要集中在Chr.10和Chr.11上)只占群體的9%,供體片段均勻分布在12條染色體上,覆蓋整個基因組。經(jīng)統(tǒng)計:供體片段累計達(dá)211個,平均每個家系包含3.29個供體片段,每個供體片段平均在1.61個家系中重復(fù)出現(xiàn)。利用126對SSR標(biāo)記對以IR24為受體,以Asominori為供體的NIAS置換系構(gòu)建基因型圖譜。在秈稻置換系中,15%的家系為單片段置換系,49%的家系包含2-4個供體片段,21%的家系包含5-6個供體片段,而大
5、于7個供體片段(主要集中在Chr.6和Chr.12上)的家系只占12%,供體片段覆蓋整個基因組。經(jīng)統(tǒng)計:供體片段累計達(dá)209個,平均每個家系包含3.66個供體片段,每個供體片段在1.65個家系中重復(fù)出現(xiàn)。
2.粒形性狀表型變異分析:NAIS群體在南京和貴陽環(huán)境中粒形性狀對比發(fā)現(xiàn)粒寬和長寬比幾乎沒有差異,粒長在南京環(huán)境下比在貴陽平均略長0.13mm,相應(yīng)的粒面積也增加了0.65mm2,說明粳稻更適合在長日照條件下生長。NIAS群
6、體在E2環(huán)境中相對于E1環(huán)境粒形性狀更好,具體表現(xiàn)為粒形的長寬比適中,粒面積相對較大。說明秈稻更加適合于在多雨水肥沃的地理區(qū)域生長。而無論NAIS還是NIAS,從整個置換系的表型來看,與背景親本的差異很微小,說明置換系群體中的增效片段和減效片段數(shù)量相當(dāng),彼此效應(yīng)相互抵消。而從各個家系來看,存在明顯的雙向超親現(xiàn)象,是由于各個家系包含的供體片段以及片段數(shù)量不同所致。
3.結(jié)合粒形表型數(shù)據(jù),鑒定4套群體中粒形性狀的加-顯QTL。利用
7、NAIS及NAISF1在2個環(huán)境中檢測到3個影響粒長的加-顯性QTL。qGL2-1-I同時具有加性和顯性效應(yīng),其余QTL只表現(xiàn)出加性效應(yīng);6個影響粒寬的加-顯性QTL,qGW1-1-I在貴陽中同時具有加性和顯性效應(yīng);6個影響谷粒長寬比的加-顯性QTL,qLWR1-1-I在兩個環(huán)境中同時表現(xiàn)出加性和顯性效應(yīng),且都表現(xiàn)為負(fù)向的減小表型的作用;4個影響粒面積的加-顯性QTL,且都只表現(xiàn)出加性或者顯性效應(yīng)。利用NIAS及NIASF1在2個環(huán)境中
8、共檢測到2個影響粒長的加-顯性QTL,qGL3-1-A和qGL4-1-A在貴陽環(huán)境中同時具有加性和顯性效應(yīng),而在南京環(huán)境中qGL3-1-A只表現(xiàn)為顯性效應(yīng),qGL4-1-A只表現(xiàn)為加性效應(yīng);5個影響粒寬的加-顯性QTL,qGW2-1-A在南京點中同時檢測到加性和顯性效應(yīng);4個影響谷粒長寬比的加-顯性QTL,qLWR3-1-A和qLWR5-1-A在兩個環(huán)境中同時表現(xiàn)出加性和顯性效應(yīng);2個影響粒面積的加-顯性QTL,且都只表現(xiàn)出加性或者顯性
9、效應(yīng)。
4.根據(jù)粒形性狀的中親優(yōu)勢值,結(jié)合基因型數(shù)據(jù),檢測了F1群體中的雜種優(yōu)勢位點。粳稻中檢測到1個較穩(wěn)定的粒長HL位點,位于RM411標(biāo)記附近具有顯著的優(yōu)勢作用;1個穩(wěn)定的粒寬HL位點,位于標(biāo)記RM493附近且該標(biāo)記同時為加性和顯性QTL位點;2個長寬比HL位點,位于RM411、RM493標(biāo)記處;秈稻中檢測到1個穩(wěn)定的粒長HL位點,位于RM3467標(biāo)記處,且重演性強(qiáng);1個長寬比HL位點,位于RM3467標(biāo)記處且該標(biāo)記同時為
10、加顯性QTL位點;粒寬、粒面積則未檢測到穩(wěn)定的HL位點。
5.比較加性效應(yīng)值和顯性效應(yīng)值,計算平均顯性度|D/A|值,分析各粒形性狀的遺傳基礎(chǔ)。結(jié)果顯示,粳稻背景下粒長的遺傳主要為加性效應(yīng),粒寬的遺傳主要為超顯性和部分顯性,長寬比的遺傳主要為部分顯性,粒面積的遺傳則主要為顯性效應(yīng)。秈稻遺傳背景下,粒長、粒寬、長寬比的遺傳主要為部分顯性效應(yīng),粒面積的遺傳主要為顯性效應(yīng)。
6.從粒形性狀的加性和顯性效應(yīng)的QTL在染色體上
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