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![“越光-9311”染色體片段置換系的構(gòu)建及稻米品質(zhì)性狀QTL的分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/7f57f0a6-d47a-46b1-aa29-6520626902c5/7f57f0a6-d47a-46b1-aa29-6520626902c51.gif)
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文檔簡介
1、隨著我國社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和居民生活水平的提高,優(yōu)質(zhì)稻米的需求和消費(fèi)量與日俱增。稻米品質(zhì)的遺傳改良和栽培調(diào)優(yōu)已成為當(dāng)前我國稻作科學(xué)研究的熱點(diǎn)。本研究以粳稻品種越光(Koshihikari)作為供體親本,秈稻品種9311(揚(yáng)稻6號(hào))作為受體親本,結(jié)合分子標(biāo)記輔助選擇構(gòu)建置換片段能覆蓋水稻全基因組的染色體片段置換系。以此開展稻米品質(zhì)性狀尤其是蒸煮食味品質(zhì)性狀的QTL定位研究。主要結(jié)果如下:
1)參照已發(fā)表的SSR標(biāo)記連鎖圖譜合成了分布在
2、水稻12條染色體上的612對(duì)SSR引物,開展了越光和9311間多態(tài)性的篩選。共發(fā)現(xiàn)189個(gè)多態(tài)性標(biāo)記,占標(biāo)記總數(shù)的30.88%。多態(tài)性標(biāo)記在不同染色體上的分布不均勻,染色體間數(shù)目差別較大。其中第11染色體上多態(tài)性標(biāo)記的比例最低,僅有17.50%;而第2和10號(hào)染色體上的比例較高,達(dá)到了41.49%和41.18%。選擇在12條染色體上相對(duì)分布均勻的108對(duì)共顯性標(biāo)記,參照McCouch等發(fā)表的遺傳連鎖圖譜,構(gòu)建了分子標(biāo)記連鎖圖。利用該分子
3、標(biāo)記連鎖圖分析“越光/9311”BC5F3世代的基因型,分子標(biāo)記輔助選擇目標(biāo)單株。
2)通過雜交回交結(jié)合分子標(biāo)記輔助選擇構(gòu)建染色體片段置換系。研究獲得BC5F3世代共208個(gè)株系。通過多態(tài)性SSR標(biāo)記篩選,鑒定出138個(gè)株系,每個(gè)株系都含有至少一個(gè)越光的染色體片段,這138個(gè)株系構(gòu)成CSSLs。CSSLs的基因組信息分析結(jié)果顯示,“越光/9311”CSSLs的水稻全基因覆蓋率為89%。置換系群體的單一株系置換片段數(shù)的變異范圍在
4、1-17個(gè)之間;其中單片段置換系達(dá)到了50個(gè)。全部置換片段的長度為8704.95 cM,相當(dāng)于水稻基因組大小的5.8倍。不同染色體上置換片段數(shù)存在差異,其中第1、2、3、6、7、8和9號(hào)染色體上的置換片段相對(duì)分布較多,分別有44、45、46、55、46、59和59個(gè);第11號(hào)染色體上置換片段相對(duì)較少,只有4個(gè)置換片段。
3)以“越光/9311”染色體片段置換系為材料,利用QTL Icimapping v3.3軟件,對(duì)水稻農(nóng)藝及
5、外觀品質(zhì)部分性狀進(jìn)行QTL分析?;趩螛?biāo)記分析共發(fā)現(xiàn)控制5個(gè)性狀的27個(gè)QTL。其中控制水稻株高的QTL3個(gè),控制穗長的QTL17個(gè),控制每穗粒數(shù)的QTL2個(gè),控制粒長的QTL4個(gè),控制長寬比的QTL2個(gè)。利用基于逐步回歸的加性QTL似然比檢測法,共檢測到控制5個(gè)性狀的13個(gè)QTL,其中株高QTL3個(gè),穗長QTL2個(gè),每穗粒數(shù)QTL3個(gè),控粒長QTL4個(gè),長寬比QTL1個(gè)。發(fā)現(xiàn)3個(gè)一因多效的加性QTL。其中以標(biāo)記RM235為核心標(biāo)記的Q
6、TL同時(shí)控制穗長和每穗粒數(shù);以RM532為核心標(biāo)記的QTL同時(shí)控制每穗粒數(shù)和粒長;以標(biāo)記RM411為核心標(biāo)記的QTL同時(shí)控制粒長及長寬比?;谥鸩交貧w的雙基因的上位性檢測法檢測到4個(gè)性狀的28個(gè)上位性QTL。
4)以RVA譜特征值為主要評(píng)價(jià)指標(biāo),對(duì)稻米蒸煮食味品質(zhì)性狀相關(guān)性狀進(jìn)行了QTL定位。單標(biāo)記分析共定位控制6個(gè)性狀的9個(gè)QTL、其中控制熱漿黏度的QTL1個(gè)、控制冷膠黏度的QTL1個(gè)、控制糊化溫度的QTL3個(gè)、控制醇溶蛋白
7、含量的QTL1個(gè)、控制谷蛋白含量的QTL2個(gè)、控制總蛋白質(zhì)含量的QTL1個(gè)。利用基于逐步回歸的加性QTL似然比檢測法,定位出控制6個(gè)性狀10個(gè)QTL,其中控制熱漿黏度的QTL1個(gè)、控制冷膠黏度的QTL1個(gè)、控制糊化溫度的QTL3個(gè)、控制醇溶蛋白含量的QTL1個(gè)、控制谷蛋白含量的QTL2個(gè)、控制總蛋白質(zhì)的QTL2個(gè)。發(fā)現(xiàn)2個(gè)QTL具有多項(xiàng)效應(yīng),位于標(biāo)記RM565區(qū)域的QTL同時(shí)控制谷蛋白和總蛋白含量,位于標(biāo)記RM432位置的QTL同時(shí)控制
8、熱漿黏度、谷蛋白及總蛋白含量。利用復(fù)合區(qū)間作圖法定位RVA譜特征值,共定位到位于6條不同染色體上9個(gè)區(qū)域的10個(gè)QTL,表型貢獻(xiàn)率范圍為8.85%-42.65%,其中qBDV-1、qPT-4.1、qPT-4.2和qCSV-3等4個(gè)QTL為首次報(bào)道。基于逐步回歸的雙基因的上位性檢測法檢測3個(gè)性狀的16個(gè)上位性QTL。
本研究所構(gòu)建的138個(gè)9311/越光CSSLs,為稻米品質(zhì)形成與調(diào)控機(jī)制研究提供了新材料;所定位的農(nóng)藝性狀、外觀
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