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![利用表達譜芯片探究六溴環(huán)十二烷對海水青鳉的毒性效應.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-2/24/2/a94ece26-713a-4e08-9fa5-7f3e7e97f6ce/a94ece26-713a-4e08-9fa5-7f3e7e97f6ce1.gif)
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文檔簡介
1、本文以海水青鯔(Oryziasmelastigma)作為動物模型,采用環(huán)境水平(0、0.2nM、2nM和20nM)的溴系阻燃劑六溴環(huán)十二烷(Hexabromocyclododecane,HBCD)對出膜后24小時的仔魚進行暴露。利用商品化的表達譜芯片檢測暴露7天后的海水青鯔的基因表達情況,對獲得的差異基因進行生物信息學分析,探討利用毒理基因組學技術分析HBCD對海洋魚類毒性效應的可行性。在此基礎上,從形態(tài)學和組織學水平初步分析環(huán)境水平的
2、HBCD暴露90天對海水青鳉的神經和生殖系統(tǒng)的影響。
主要研究結果如下:
1.本研究首先利用GeneSpring11.0軟件對芯片數據進行火山圖和MDS降維分析,結果顯示芯片樣本組間呈現一定的空間排列,且隨著濃度的升高,差異基因的總數增多,證明芯片雜交質量良好,結果可靠。之后,通過SAM分析,我們共篩選得到872個顯著性差異基因,我們挑選其中部分差異表達基因進行qPCR驗證,結果與芯片基本一致。同時,我們對差
3、異表達基因進行K-meansclustering分析,結果顯示出四種主要的表達模式,并表現出良好的劑量依賴效應。
2.對差異基因進行DAVID、KEGG、IPA-TOX等功能注釋發(fā)現,HBCD暴露的影響主要涉及核糖體、堿基切除修復、磷酸戊糖途徑、蔗糖和淀粉代謝有關的生命活動以及P53、Wnt和Notch等信號轉導通路,并對TR/RX、CAR/RXR異源二聚體的激活,肝組織壞死和PPARα基因的轉錄調控產生顯著影響,其中顯著
4、上調的基因與神經系統(tǒng)發(fā)生有密切關系(EnrichmentScore=1.4343),暴露同時也影響生殖,雖然其表現較弱(EnrichmentScore=0.2962)。結合CTD數據庫,我們從差異表達基因中篩選出一些與生殖毒性相關的重要的調控基因,如notch1a,、edn1、hoxd4a等。以這些基因為關鍵詞基因,我們利用cytoscape軟件構建了HBCD引發(fā)生殖毒性的可能調控網絡,并對其中幾個關鍵節(jié)點基因進行qPCR驗證,結果顯示
5、與芯片變化趨勢一致。
3.對海水青鯔進行環(huán)境水平的HBCD暴露90天后,海水青鳉端腦的神經膠質細胞數目在20nM組顯著降低,并且中腦視頂蓋顆粒細胞層厚度隨濃度升高而變薄,呈劑量依賴效應。這些結果表明,HBCD暴露的確能對神經系統(tǒng)造成毒性作用。
4.對海水青鯔進行環(huán)境水平的HBCD暴露90天后,海水青鳉的產卵率以及F1代出膜率均無顯著改變,但性別比例受到影響,且暴露后雄魚精子細胞囊個體排列分散,雌魚卵泡顆粒細胞
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