山葡萄果皮cDNA文庫構(gòu)建及相關(guān)基因的克隆與表達.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、山葡萄漿果含有前花色苷、蛋白質(zhì)及礦物質(zhì)等營養(yǎng)元素,是具有很高經(jīng)濟價值的果樹資源。本試驗以山葡萄果皮為材料,成功構(gòu)建了轉(zhuǎn)色前果皮cDNA文庫;并利用RACE方法克隆了CHS和CHI基因cDNA全長序列,進行了生物信息學(xué)分析;采用實時熒光定量PCR技術(shù)對山葡萄果皮成熟的7個時期的基因表達進行了分析。主要研究結(jié)果如下:
  以山葡萄轉(zhuǎn)色前果皮為試驗材料,采用In-Fusion(@)SMARTer(@)DirectionalcDNA Li

2、brary Construction技術(shù)構(gòu)建了cDNA文庫,經(jīng)鑒定,文庫初始滴度及擴增后滴度分別為1.15×106pfu.mL-1和2.86×109 pfu.mL-1,插入片段長度約為0.5-2.0kb,平均0.9kb,重組率高達100%。這些結(jié)果說明,本試驗在山葡萄轉(zhuǎn)色前果皮中成功構(gòu)建了cDNA文庫。為今后山葡萄功能基因分離克隆和功能基因組學(xué)研究建立了基礎(chǔ)。
  通過RT-PCR結(jié)合快速擴增cDNA末端(RACE)方法,獲得到了

3、CHS和CHI基因的全長cDNA序列。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,這兩個基因都具有完整的開放閱讀框,其中,CHS基因的cDNA全長1461bp,含有一個1182bp的開放閱讀框(ORF),編碼393個氨基酸殘基的蛋白質(zhì);CHI基因的cDNA全長955bp,含有一個705bp的ORF,編碼234個氨基酸殘基的蛋白質(zhì)。共有的特性是:均為穩(wěn)定蛋白質(zhì)、整個多肽鏈表現(xiàn)為親水性、不含跨膜結(jié)構(gòu)域、編碼的蛋白不具有信號肽、分子發(fā)育樹分析表明,均與歐亞種葡萄

4、同源性最高。
  以山葡萄成熟過程中的7個時期漿果果皮為試驗材料,ACTIN為內(nèi)參基因,采用實時熒光定量PCR技術(shù),分析了CHS和CHI基因的表達模式。結(jié)果顯示,在7個時期中均有表達,除了轉(zhuǎn)色前和10%轉(zhuǎn)色時期二者的表達量相近之外,其它5個時期中,CHS基因的表達量均明顯高于CHI基因。且CHS基因在七個時期中表達具有明顯的規(guī)律性,從轉(zhuǎn)色前至100%成熟期表達量呈依次增加的趨勢,完熟期表達量下降。而CHI基因的表達量沒有明顯的規(guī)律

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