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文檔簡介
1、山葡萄(Vitis amurensis Rupr.)是我國重要的野生果樹資源?;ㄉ帐巧狡咸压麑嵵兄饕亩喾宇惔紊x產(chǎn)物,與山葡萄的抗病性、色澤、風(fēng)味等密切相關(guān)?;ㄉ詹粌H影響植物源食品的感官和營養(yǎng)價值,還具有多種醫(yī)藥方面的生理活性。本文進(jìn)行了山葡萄轉(zhuǎn)色期果皮eDNA文庫的構(gòu)建,對山葡萄花色苷生物合成相關(guān)結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行了克隆和序列分析,對山葡萄果實不同成熟期,不同組織與器官中花色苷合成的相關(guān)基因表達(dá)進(jìn)行了初步研究。主要研究結(jié)果如下:
2、r> 通過三種提取方法提取山葡萄果皮和葉片中的總RNA,其中改良CTAB法能分離出高質(zhì)量的RNA,可用于下一步的分子生物學(xué)研究。以轉(zhuǎn)色期(50%著色)山葡萄果皮為材料,提取總RNA合成cDNA,連接到質(zhì)粒載體pDNR-LIB上,采用電穿孔法將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到DH5α中,成功構(gòu)建了山葡萄果皮cDNA文庫。文庫質(zhì)量鑒定表明,原始文庫滴度為1.12×106pfu·mL-1,擴(kuò)增后的文庫滴度為2.82×109 pfu·mL-1,重組率接近1
3、00%,插入片段大小范圍在0.5~2kb之間,平均約為0.80 kb,表明應(yīng)用SMARTTM技術(shù)已成功構(gòu)建了山葡萄轉(zhuǎn)色期果皮cDNA文庫。
山葡萄轉(zhuǎn)色期果皮cDNA文庫測序獲得974條有效EST序列。GenBank登錄號:GW666520~GW667493。974條EST拼接后代表了710個Unigenes。BLAST注釋結(jié)果表明,具有已知或推測功能基因270個,未知功能基因258個,未比對上的基因182個(可能是新基因)
4、。根據(jù)BLASTX注釋與GO分類,199條EST序列具有細(xì)胞組件功能,313條EST序列在分子功能上得到注釋,341條EST序列在生物學(xué)途徑上得到注釋。
采用RT-PCR、SMARTTM RACE技術(shù)從山葡萄成熟期果皮中克隆到了類黃酮-3'-羥化酶(VAmF3'H)、類黃酮-3,5'-羥化酶(VAmF3'5'H)、黃烷酮醇4-還原酶(VAmDFR)、無色花色素雙加氧酶(VAmLDOX)、類黃酮3-O-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶(VAm
5、3GT),O-甲基轉(zhuǎn)移酶(VAmOMT),谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶(VAmGST4)和類黃酮5-O-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶(VAmOGT)等8個基因的cDNA全長序列。GenBank登錄號為:FJ645766、FJ645767、FJ645768、FJ645769、FJl69463、GU237132、FJ645770和GU237133。利用生物信息學(xué)分析,推測8個基因分別編碼509、508、337、355、456、235、213和448個氨基酸的多肽,分子
6、量為56.14、56.70、37.50、40.19、50.19、26.35、24.24和49.84 kDa。與其它物種相關(guān)基因的氨基酸序列進(jìn)行了多重比較,各基因與歐亞種葡萄(Vitis vinfera L.)相關(guān)基因的相似性均超過90%。在此基礎(chǔ)上構(gòu)建了這8個基因與其它物種相應(yīng)基因的分子進(jìn)化樹,分析了與其它物種相關(guān)基因的親緣關(guān)系。各基因信號肽預(yù)測結(jié)果表明,8個基因都不具有信號肽結(jié)構(gòu),對各基因分別進(jìn)行了疏水性分析,初步預(yù)測了其二級結(jié)構(gòu)。<
7、br> 對山葡萄幼葉、成熟葉、莖、果肉和果皮中花色苷生物合成結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)進(jìn)行了初步研究。半定量RT-PCR分析結(jié)果表明,VAmF3'H和VAmF3'5'H在花后各個時期的果皮中均有表達(dá),轉(zhuǎn)色期上調(diào)表達(dá);VAmDFR、VAmLDOX和VAmOGTG在花后各個時期的果皮中均有表達(dá),各個時期的表達(dá)強(qiáng)度差異不明顯;VAm3GT和VAmGST4在果實轉(zhuǎn)色期前基本不表達(dá),轉(zhuǎn)色期為上調(diào)表達(dá);VAmOMT在花后兩周有少量表達(dá),隨后表達(dá)量下降,轉(zhuǎn)
8、色期開始上調(diào)表達(dá)。VAmF3'H、VAmF3'5'H,VAmDFR、VAmLDOX和VAmOGT在各個組織與器官中均有表達(dá),但VAmF3'5'H在成熟葉中的表達(dá)量很少;VAm3GT、VAmOMT和VAmGST4在葉片中都不表達(dá),在莖、果肉、果皮中都有表達(dá),VAmOMT在果肉中表達(dá)豐度低。Northern雜交結(jié)果表明,VAm3GT在果實轉(zhuǎn)色期前基本不表達(dá),轉(zhuǎn)色期上調(diào)表達(dá);VAmOGT在果實成熟過程中均有表達(dá)。
用DNA重組技
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