脆性X綜合征PCR篩查方法學的建立.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的: 脆性X綜合征(Fragile X Syndrome)是一種常見的遺傳性智力低下綜合征,其發(fā)病率僅次于Down's綜合征,呈X連鎖遺傳。男性發(fā)病率為1/4000,女性為1/6000-8000。大多數(shù)的脆性X綜合征男性患者,存在顯著的智力低下,IQ值在20~70之間,表現(xiàn)為學習障礙,重度智力低下及自閉癥樣行為。 脆性X綜合征發(fā)病的分子遺傳學基礎是脆性X綜合征智力低下基因1(Fragile X mental retar

2、dation gene1,F(xiàn)MR1基因)(CGG)n結(jié)構(gòu)的擴展突變。(CGG)n重復序列的長度具有多態(tài)性,并且可以遺傳,在遺傳過程中易發(fā)生突變。當n擴展達到200次以上時,這種突變類型為全突變,常伴CpG島異常甲基化,F(xiàn)MR1基因失活,導致FMRP缺失,引起脆性X綜合征。 脆性X綜合征發(fā)病率在遺傳性智力低下綜合征中排第二位,該病的產(chǎn)生給患者、家庭和社會帶來沉重的經(jīng)濟負擔和精神負擔。因為目前尚未出現(xiàn)明確有效的治愈方法,所以防治本病

3、的關鍵在于降低其發(fā)病率,開展廣泛的篩查工作,對攜帶者及患者予以遺傳咨詢和產(chǎn)前診斷,阻止患兒的出生。 目前美國醫(yī)學遺傳學協(xié)會已公布出進行FMR1分子診斷的適用人群;大多數(shù)國家則已對脆性X綜合征開始實行針對性篩查,即針對通過家族史分析而確定的高危孕婦進行篩查;而部分國家,如芬蘭、以色列,更是在孕婦中進行常規(guī)篩查。在各國對脆性X綜合征都已有了正規(guī)的程序化的篩查診斷時,我國至今還沒有任何針對脆性X綜合征篩查的產(chǎn)品的問世,也仍未曾進行過廣

4、泛的篩查診斷工作,在脆性X綜合征篩查診斷和防治方面遠遠落后于其他國家。 脆性X綜合征的篩查診斷難以普及、各國沒有統(tǒng)一的篩查診斷方案,緣于脆性X綜合征的臨床表現(xiàn)多樣,臨床診斷困難,必須依靠實驗室診斷,而現(xiàn)有的各種脆性X綜合征實驗室篩查技術(shù)又存在以下的問題:費用昂貴;費時;條件、技術(shù)要求高;適用范圍不廣等。 所以本實驗擬建立一個費用低廉;快速;操作簡便,技術(shù)要求低;可以涵蓋男性、女性受檢者,包括(CGG)n正常范圍、所有前突

5、變及部分全突變的脆性X綜合征PCR篩查方法。 方法: 本實驗包括2項主要內(nèi)容: 1、快速DNA重亞硫酸氫鹽修飾。常規(guī)方法是使用氫氧化鈉將DNA化學變性,加入重亞硫酸氫鹽等過夜修飾單鏈DNA,用氫氧化鈉使DNA脫磺化完成向尿嘧啶的轉(zhuǎn)化并用樹脂純化修飾后的DNA。本實驗將預先準備好的DNA修飾粉劑配制成新鮮的DNA修飾液與DNA混合后,采用溫度變性(99℃)取代以往方案中的化學變性過程,在5min熱變性后直接過夜修飾

6、,再用達安研發(fā)的試劑盒使DNA脫磺化并純化DNA。 2、脆性X綜合征PCR體系建立。以修飾后的DNA反義鏈為模板在(CGG)n兩側(cè)設計引物進行熱啟動PCR,擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳和ABI3100測序儀片段分析檢測(CGG)n重復次數(shù),并進一步克隆、測序驗證。 結(jié)果: 1、經(jīng)克隆測序驗證兩種方法對(CGG)n的修飾均可達到100%,但采用快速方法的得率更高,其PCR產(chǎn)物電泳條帶比常規(guī)方法更亮,該方法還縮短了時間,

7、避免樹脂純化時正壓排液的不便,更方便臨床實驗室的應用。 2、通過測試4個(CGG)n重復次數(shù)已知的前突變、全突變男性和女性細胞株DNA、2個正常范圍的男性和女性DNA,該優(yōu)化的PCR反應體系可以擴增出大片段的(CGG)n重復序列,涵蓋所有前突變及部分全突變序列。應用ABI3100測序儀片段分析可精確檢測部分(CGG)n重復次數(shù),通過優(yōu)化PCR添加劑,避免重復序列常見的影子帶,令分子診斷得出最準確的結(jié)果。 結(jié)論:

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