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![中華蜜蜂頭部cDNA芯片研制及基于芯片的抗螨性研究.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/b401e8ac-376d-46cf-970a-eceb687a8e75/b401e8ac-376d-46cf-970a-eceb687a8e751.gif)
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文檔簡介
1、大蜂螨(狄氏瓦螨,Varroa destructor)是嚴(yán)重危害西方蜜蜂(Apis mellifera,主要是意大利蜜蜂,即意蜂A.mellifera lingustica)的蜂螨,但大蜂螨對原產(chǎn)于我國的中華蜜蜂(中蜂,Apis ceranacerana)則沒有明顯的危害。其原因是中蜂為大蜂螨的原始寄主,在長期協(xié)同進化過程中,該蜂已經(jīng)形成了很強的防衛(wèi)機制和行為。中蜂的這種抗螨特異性是可遺傳的,因此本研究在構(gòu)建中蜂頭部cDNA芯片的基礎(chǔ)上
2、,對中蜂抗螨性的分子機制進行了探索分析。
主要研究內(nèi)容如下:
1.利用已構(gòu)建好的中蜂頭部cDNA文庫,從8569條高質(zhì)量ESTs序列中,共拼接出基本覆蓋所有序列217條Contigs、788條singlets,由此獲得基因芯片的1025條候選ESTs。通過PCR擴增,最終獲得717條高質(zhì)量ESTs。通過BLAST檢索,對ESTs序列進行了功能注釋,其中有功能尚不明確的ESTs588條,功能明確的基因129條。
3、對這129條基因進行了Gene Ontology分類,按照細(xì)胞功能(Molecular function)、生物過程(Biological process)以及細(xì)胞組分(Cellulalcomponent),將ESTs分成三類,并統(tǒng)計了每大類下各小類的分布情況。構(gòu)建了較為完善的cDNA芯片數(shù)據(jù)庫。
2.對候選ESTs進行了PCR擴增和純化,采用點樣法完成了中蜂頭部cDNA芯片制備。該芯片分為三個矩陣,每個矩陣又分為4個亞矩
4、陣,每個矩陣含有717×2個ESTs探針。每張芯片設(shè)計三個矩陣既可以同時進行三次重復(fù),也可以同時檢測三個不同樣品,具有高通量,操作簡便等優(yōu)點。對芯片掃描檢測結(jié)果表明,該芯片矩陣排布整齊,探針點形狀規(guī)則,直徑為90.63±15.87μm,熒光背景低,無連點,2個重復(fù)點大小形狀基本上一致,信號的差異系數(shù)大于0.33的低于30%,點樣成功率超過97%。結(jié)果表明,該基因芯片探針點大小均一,點制的重復(fù)性好。
3.標(biāo)記新出房中蜂、意蜂
5、工蜂,定期回捕后,用活蜂螨接種麻醉工蜂,籠養(yǎng)3日進行脅迫。分別提取四種不同處理的蜜蜂樣本,包括螨脅迫中蜂組和意蜂組,中蜂對照組和意蜂對照組的頭部總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,并作熒光標(biāo)記,兩兩組合后分別與中蜂頭部cDNA芯片進行雜交,芯片掃描,雜交結(jié)果分析。經(jīng)初步分析,篩選出了與抗螨性相關(guān)的18條差異表達ESTs,并對其中的卵黃蛋白原Vitellogenin、化學(xué)感受態(tài)蛋白ASP3和α—1,3巖藻糖基轉(zhuǎn)移酶Alpha—(1,3)—fuco
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