啟動子區(qū)域甲基化狀態(tài)與炎癥細(xì)胞TNF-α分泌關(guān)系及調(diào)控因素的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、研究目的:測定人單核細(xì)胞系THP-1細(xì)胞在炎癥刺激時(shí)腫瘤壞死因子α(TNF-α)表達(dá)分泌的規(guī)律,確定其分泌峰值時(shí)間;研究TNF-α基因啟動子區(qū)域散在CpG雙核苷酸結(jié)構(gòu)甲基化狀態(tài)與蛋白分泌和基因表達(dá)的關(guān)系;探討TNF-α基因啟動子區(qū)域散在CpG雙核苷酸結(jié)構(gòu)甲基化狀態(tài)影響其基因表達(dá)的調(diào)控因素。
   研究方法:采用酶聯(lián)免疫分析(ELISA)法檢測人單核細(xì)胞系THP-1細(xì)胞在未受到炎癥因子刺激時(shí),其TNF-α表達(dá)分泌水平;使用終濃度為

2、 1 μg/ml的脂多糖(LPS)刺激人單核細(xì)胞系THP-1細(xì)胞,采用ELISA法檢測刺激不同時(shí)間時(shí)細(xì)胞培養(yǎng)液上清TNF-α分泌水平。對不同刺激時(shí)間分泌量與未刺激時(shí)分泌量進(jìn)行比較,確定THP-1細(xì)胞在受到終濃度為 1 μg/ml的脂多糖刺激后,TNF-α分泌高峰時(shí)間和分泌下降時(shí)間。獨(dú)立進(jìn)行4次上述測定,結(jié)果以刺激不同時(shí)間的分泌量與未刺激時(shí)分泌量比值的平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)誤表示。對刺激后分泌高峰時(shí)間和分泌下降時(shí)間其分泌水平進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,P<0.

3、05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。同時(shí)采用實(shí)時(shí)定量PCR方法測定THP-1細(xì)胞TNF-α基因表達(dá)水平。采用重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化基因測序法測定THP-1細(xì)胞在未受到炎癥刺激時(shí)TNF-α基因啟動子區(qū)域的甲基化狀態(tài)。使用終濃度為1 μg/ml LPS刺激THP-1細(xì)胞,采用重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化基因測序法測定THP-1細(xì)胞在LPS刺激分泌高峰時(shí)TNF-α基因啟動子區(qū)域的甲基化狀態(tài),以及受刺激后分泌下降時(shí)TNF-α基因啟動子區(qū)域的甲基化狀態(tài)。每個(gè)時(shí)間點(diǎn)樣本選取5個(gè)克

4、隆進(jìn)行測序,結(jié)果以所測得CpG雙核苷酸結(jié)構(gòu)甲基化數(shù)占擴(kuò)增區(qū)域總CpG雙核苷酸結(jié)構(gòu)數(shù)的百分率表示。采用卡方檢驗(yàn)對測序結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。將未刺激時(shí)、刺激分泌高峰時(shí)期、刺激分泌下降時(shí)期TNF-α表達(dá)分泌量與對應(yīng)時(shí)間點(diǎn)其基因啟動子區(qū)域的甲基化狀態(tài)進(jìn)行對比。使用實(shí)時(shí)定量PCR方法測定甲基化CpG結(jié)合蛋白表達(dá)量。并與相應(yīng)時(shí)間點(diǎn)TNF-α基因啟動子區(qū)域甲基化狀態(tài)及TNF-α分泌的關(guān)系進(jìn)行研究。
   實(shí)驗(yàn)結(jié)

5、果:受到終濃度為1 μg/ml的LPS刺激后,THP-1細(xì)胞迅速開始產(chǎn)生TNF-α,1 h過后升幅明顯增加,在4 h達(dá)到分泌高峰水平,濃度為未刺激時(shí)的48.9±1.06倍。之后快速下降,至8 h,已有明顯下降,濃度為未刺激時(shí)的36.3±1.65倍。至12 h,濃度已降至峰值一半以下。刺激4 h與未刺激時(shí)相比,TNF-α分泌量明顯升高,其差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。刺激8 h與刺激4 h相比,TNF-α分泌量明顯下降,其差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。TNF-α

6、基因啟動子區(qū)域無典型CpG島結(jié)構(gòu),其啟動子-344 bp到+57 bp區(qū)域內(nèi),存在12個(gè)散在CpG雙核苷酸結(jié)構(gòu),其中-344 bp到轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(TSS)區(qū)域內(nèi),存在11個(gè)散在CpG雙核苷酸結(jié)構(gòu)。未受到LPS刺激時(shí),該11個(gè)散在CpG雙核苷酸均處于甲基化狀態(tài);刺激4 h時(shí),有4個(gè)處于甲基化狀態(tài);刺激8 h時(shí),有9個(gè)處于甲基化狀態(tài)。未刺激時(shí),5個(gè)克隆總體甲基化率為100%,刺激4 h時(shí),5個(gè)克隆總體甲基化率為21.8%,刺激8 h時(shí),5個(gè)

7、克隆總體甲基化率為41.8%。刺激4 h時(shí)與未刺激時(shí)相比,TNF-α基因啟動子區(qū)域甲基化率明顯下降,差別具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;刺激8 h時(shí)與刺激4 h時(shí)相比,TNF-α基因啟動子區(qū)域甲基化率明顯上升,差別具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。各時(shí)間點(diǎn)甲基化率與相應(yīng)時(shí)間點(diǎn)TNF-α分泌量比值之間呈明顯負(fù)相關(guān)。未受到LPS刺激時(shí),甲基化結(jié)合蛋白(MBD1、MBD2、MeCP2)表達(dá)量均較高;刺激4 h后,MeCP2表達(dá)量明顯降低。MBD1、MBD2表達(dá)量較低;刺激8

8、h后,MBD1、MBD2、MeCP2表達(dá)量又升高。
   實(shí)驗(yàn)結(jié)論:
   1.THP-1細(xì)胞TNF-α表達(dá)分泌量與LPS刺激明顯相關(guān)。未受到LPS刺激時(shí),TNF-α表達(dá)分泌量較低。受到LPS刺激后迅速開始產(chǎn)生TNF-α,1 h過后升幅明顯增加,在4 h時(shí)達(dá)到分泌高峰水平,之后快速下降,至8 h時(shí),已有明顯下降。TNF-α表達(dá)分泌呈現(xiàn)快速開始,快速升高并快速下降的規(guī)律。
   2.TNF-α基因啟動子區(qū)域散在Cp

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