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![利用AFLP分子標(biāo)記分析草莓的遺傳多樣性.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/74d2a522-428b-4eae-9c10-496dca885d9c/74d2a522-428b-4eae-9c10-496dca885d9c1.gif)
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文檔簡(jiǎn)介
1、草莓是一種薔薇科草莓屬(Fragaria)多年生草本植物,對(duì)其種質(zhì)資源的分類涉及形態(tài)學(xué)、孢粉學(xué)、生物化學(xué)、分子生物學(xué)等領(lǐng)域,經(jīng)歷了從形態(tài)多樣性到DNA多樣性的發(fā)展過程。由于分類標(biāo)準(zhǔn)不統(tǒng)一,分類手段的局限性,導(dǎo)致了分類結(jié)果的不一致。部分品種來源不明,同名異物及同物異名現(xiàn)象十分普遍,阻礙了草莓種質(zhì)資源的研究和品種的選育。AFLP分子標(biāo)記具有高效、穩(wěn)定、可靠的特點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于品種鑒定、遺傳多樣性分析、遺傳連鎖圖譜構(gòu)建等方面。本研究在建立適合
2、AFLP銀染技術(shù)體系的基礎(chǔ)上,構(gòu)建了52份草莓供試樣品的樹狀圖,并對(duì)其遺傳多樣性進(jìn)行了分析。主要結(jié)果如下: 1.確定了適于AFLP分析的草莓基因組DNA的提取方法(改良CTAB法),其提取液成分為:基本提取液(100mmol/L Tris-HCl,20mmol/LEDTA,1.4mol/L NaCl,2%CTAB)中添加1%PVP-40、1%Vc、10mmol/LNa<,2>S<,2>O<,5>和2%β-巰基乙醇等防酚抗氧化物質(zhì)
3、。粗提后的DNA經(jīng)RNase酶除去RNA,苯酚/氯仿抽提一次,氯仿/異戊醇抽提一次,無水乙醇沉淀,得到了RNA去除徹底、純度高、質(zhì)量好的草莓基因組DNA。 2.建立了適于草莓分析的AFLP銀染技術(shù)體系:采用由稀有堿基切點(diǎn)酶MseI和常見堿基切點(diǎn)酶EcoRI同時(shí)進(jìn)行酶切,MseI和EcoRI的用量各為3U,酶切時(shí)間以37℃下酶切4小時(shí)為最佳:加入接頭后,37℃連接10h以上(或過夜);連接產(chǎn)物稀釋10倍后進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增;預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物稀釋
4、10倍后再進(jìn)行選擇性擴(kuò)增;加10μL Loading buffer,95℃變性10min,立即冰??;在6%變性聚丙烯酞胺凝膠上進(jìn)行電泳分析;銀染法檢測(cè)PCR產(chǎn)物。 3.從90對(duì)引物組合中篩選出15對(duì)多態(tài)性高、條帶清晰、分布均勻的引物組合用于材料分析,共擴(kuò)增出可統(tǒng)計(jì)條帶851條,平均每對(duì)引物擴(kuò)增帶數(shù)為56條。其中多態(tài)性條帶583條,占總帶數(shù)的68.5%。 4.應(yīng)用NTSYSpc2.10軟件計(jì)算相似系數(shù)介于0.533~0.9
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