移植腎慢性排斥反應外周血miRNA表達譜篩查與靶基因預測.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、腎移植是治療尿毒癥的最佳手段,移植術后排斥反應的發(fā)生往往不可避免。隨著移植配型技術的進步以及新型免疫抑制劑的開發(fā)使用,腎移植術后急性排斥反應的發(fā)生率顯著下降,但慢性排斥反應仍然嚴重威脅著移植腎的長期存活。移植腎穿刺活檢是診斷慢性排斥反應的金標準,但穿刺活檢屬于有創(chuàng)檢查,存在一定的并發(fā)癥,增加受者的心理及生理負擔。常規(guī)生化檢驗與影像學檢查無法確定是否存在慢性排斥反應,所以,臨床上迫切需要尋找一種無創(chuàng)的、高敏感性、高特異性的生物學指標,能夠

2、實現慢性排斥反應的無創(chuàng)診斷。
  微小RNA(microRNA、miRNA)是一類內源性單鏈RNA,具有轉錄后調控基因表達的功能。miRNA在人體生長發(fā)育、細胞凋亡等各種病理生理過程中發(fā)揮重要的調控作用,人體內miRNA表達量的改變與各種生理和病理狀態(tài)密切相關,比較不同狀態(tài)下miRNA表達譜可以發(fā)現特征性表達的miRNA,這既是優(yōu)良的疾病標志物,還可用作疾病的防治靶標及機制研究的切入點。
  目的:
  1、比較移植腎

3、慢性排斥反應與術后穩(wěn)定恢復受者外周血miRNA表達譜的不同,篩選出特征性表達的miRNA,為實現慢性排斥反應的無創(chuàng)診斷提供參考;2、預測特征性表達miRNA所調控的靶基因,為后續(xù)移植腎慢性排斥反應相關機制研究提供基礎。
  方法:
  選擇3例經移植腎穿刺病理明確診斷為“T細胞介導的慢性排斥反應”的受者為實驗組,3例腎移植術后移植腎穿刺病理診斷無異常的受者為對照組。抽取兩組受者外周靜脈血,提取血液RNA,進行純度及完整性檢測

4、、poly(A)加尾、Flash Tag Biotin HSRLigation標記、Affymetrix-miRNA芯片雜交,掃描儀掃描芯片結果,進行芯片數據分析,比較兩組miRNA表達譜差異,篩選出特征性表達的miRNA,運用TaqMan探針的方法進行實時定量熒光聚合酶鏈反應(qRT-PCR)驗證芯片結果。采用mirecords數據庫檢索差異表達的miRNA調控的靶基因,初步分析靶基因分布特征。
  結果:
  1、兩組血

5、液樣本總RNA濃度均大于34.9ng/ml,在260nm/280nm的吸收峰值均介于1.8-2.1;甲醛變性凝膠電泳結果顯示兩組樣本均出現兩條粗亮而濃的條帶,最上面一條28S和下面一條18S,且28S條帶的亮度幾乎為18S的兩倍。表明抽提的RNA純度及完整性較好,質量檢測合格,未出現明顯降解及污染等跡象。
  2、miRNA表達譜芯片結果:Affymetrix-miRNA芯片總共檢測了6658種miRNA在兩組之間的表達差異情況,

6、結果顯示34種miRNA表達存在顯著差異(p<0.05);其中12種表達上調,miR-4423-3p上調最明顯(7.09倍),上調表達的miRNA多定位于1號和2號染色體;22種miRNA表達下調,miR-3613-5p下調最明顯(0.08倍),下調表達的miRNA多定位于9號和14號染色體。
  3、實時熒光定量PCR結果:選取miR-4423-3p和miR-133a-3p進行實時熒光定量PCR驗證,結果顯示miR-133a-3

7、p及miR-4423-3p表達差異倍數與芯片結果吻合,說明芯片檢測結果可靠。
  4、靶基因查詢顯示差異表達的34種miRNA共調控約9003種靶基因表達,這些靶基因部分分布在炎癥反應、血管再生、淋巴細胞活化、細胞增殖等方面。
  結論:
  腎移植慢性排斥反應受者外周血miRNA表達譜存在特征性改變,這些特征性miRNA所調控的靶基因與炎癥、淋巴細胞活化、血管再生、纖維化等過程有關。這可能為臨床尋找診斷慢性排斥反應的

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