葉銹菌誘導的TcLr24 cDNA文庫構建及GMP合成酶基因的克隆與分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、小麥葉銹病是由小麥葉銹菌(Puccinia triticina)引起的一種世界性小麥重要病害,抗病品種的選育和合理利用是防治該病最經(jīng)濟、有效和環(huán)保安全的方法??共』虻目寺〖跋嚓P功能研究為基因的合理利用提供重要依據(jù)。
  小麥抗葉銹病基因Lr24來源于長穗偃麥草(Agropyron elongatum),國內(nèi)外目前未見有對該基因有毒力菌株的報道。本研究以小麥抗葉銹近等基因系TcLr24幼苗為材料,構建受小麥葉銹菌脅迫的cDNA文庫

2、,并對文庫進行了初步篩選;繼而以一個TcLr24中特異表達的RNF片段為靶序列,通過cDNA末端快速擴增(RACE)技術獲得其cDNA序列全長,并構建的原核表達載體對該基因進行原核表達。主要研究結果如下:
  1、以TcLr24為材料,分別于接菌后0h、6h、12h、18h、24 h、36h、48 h、60 h、72 h、96 h剪取葉片,提取各時間點的總RNA,等量混合后純化mRNA作為反轉(zhuǎn)錄模板。用In-Fusion SMAR

3、TerTM Directional cDNA Library Construction Kit構建了不同時間點混合的TcLr24葉片的cDNA文庫。文庫包含2.1×106個單克隆,插入片段介于在0.5-1.5 kb之間,平均插入片段大小為1.0 kb。隨機挑取30個克隆進行測序,經(jīng)比對發(fā)現(xiàn)與ATP結合蛋白、細胞周期T1家族蛋白、纖維鞘CABYR結合蛋白、生長素轉(zhuǎn)運蛋白和組蛋白去乙?;窰DAC3等相關的EST序列。
  2、以前期

4、研究利用RNA指紋圖譜技術獲得的在TcLr24和Thatcher與小麥葉銹菌互作時的差異表達片段R27和3'RACE序列為靶序列,提取TcLr24的總RNA并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,設計5'RACE擴增引物,應用Touchdown程序從cDNA模板中擴增得到750bp的目的片段,經(jīng)回收測序,成功與靶序列拼接,得到cDNA1475 bp全長基因序列。根據(jù)開放閱讀框兩側(cè)設計全長基因引物,分別在TcLr24 gDNA和cDNA中獲得1048bp和1

5、816bp的條帶并測序?;蚪Y構分析發(fā)現(xiàn),該基因含4個內(nèi)含子和5個外顯子。該基因包含1038 bp的開放閱讀框,編碼345個蛋白質(zhì)氨基酸序列,221 bp的5'非翻譯區(qū),216 bp的3'非翻譯區(qū)和29 bp的多聚腺苷酸尾,該基因編碼產(chǎn)物具有GMP合成酶、天冬酰胺合酶等結構域。進化樹分析表明:該基因與山羊草和大麥親緣關系較近,與高粱親緣關系較遠。該蛋白的分子量是38.64 kDa,是親水性蛋白。小麥染色體缺體四體定位將該基因定位于1B染

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