利用EST-CAPS標記構建桉樹遺傳圖譜.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文以尾葉桉和細葉桉兩親本及其雜交產生的124個子代為材料,運用EST-CAPS標記構建了桉樹的遺傳框架圖譜。從GenBank共下載4037條桉樹EST序列,拼接以后得到了3095條獨立序列,并對2500條獨立序列設計了PCR引物,在母本尾葉桉中能夠成功擴增的有1684條。本研究利用6種限制性內切酶,對622條擴增產物長度大于400bp的EST進行了CAPS酶切多態(tài)性篩選,得到了能在作圖群體中產生等位片段多態(tài)性的61個EST;同時,結合

2、前期開發(fā)的12個EST-CAPS標記,共有73個標記進行了作圖分析。研究結果如下:
  (1)對73個EST的酶切結果的?2檢驗(?=0.05)表明,24個標記是偏分離的,偏分離比率為32.9%。由于標記數量較少,所以將所有的標記都用于作圖分析。
  (2)分別用Mapmaker3.0、JoinMap4.0、FsLinkageMap1.0三個軟件進行了標記連鎖分析。用Mapmaker3.0在LOD為3.0的情況下,構建的圖譜

3、長度為537.3cM,有48個標記連鎖成18個連鎖群,連鎖群內標記數為2-5個。用JoinMap4.0在LOD不小于3的情況下,構建的圖譜長度為654.0cM,有49個標記連鎖成18個連鎖群,連鎖群內標記數為2-6個。用FsLinkageMap1.0在LOD為3的條件下,構建的圖譜長度為993.4cM,有63個標記連鎖成17個連鎖群,連鎖群內標記數為2-10個。比較三個軟件的分析結果,用Mapmaker3.0構建的圖譜與用JoinMap

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