胃癌染色體等位基因雜合缺失分析的精細定位研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:癌基因的激活以及抑癌基因的缺失、功能喪失是腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要環(huán)節(jié)。通過檢測腫瘤組織與相應(yīng)正常組織染色體上DNA多態(tài)性標(biāo)記的LOH發(fā)生頻率,可以推測出在LOH高發(fā)區(qū)可能存在有抑癌基因。課題組前期對胃癌進行全基因組雜合缺失分析掃描,發(fā)現(xiàn)了21個高頻雜合缺失位點。本實驗通過對其中15個位點進行雜合缺失精細定位研究,以期縮小候選胃癌相關(guān)基因的篩查范圍,為以后進一步篩選、定位、克隆胃癌相關(guān)抑癌基因,揭示胃癌發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)移的分子遺傳學(xué)機制奠

2、定基礎(chǔ)。 方法:94例經(jīng)病理證實的胃癌腫瘤組織及相應(yīng)正常粘膜組織提取DNA,用熒光標(biāo)記的微衛(wèi)星引物對胃癌及相應(yīng)正常組織DNA行“touch-down”PCR擴增,產(chǎn)物在ABI Prism 3730 DNA測序儀進行毛細管電泳及Genotyper 3.7軟件進行掃描及雜合缺失分析,計算、統(tǒng)計各定位區(qū)間位點的雜合缺失率。雜合缺失結(jié)果與臨床病理因素之間關(guān)系采用χ2檢驗(或Fisher's 確切概率檢驗)。 結(jié)果:針對15個高頻

3、雜合缺失位點進行的雜合缺失分析研究,篩選出14個腫瘤相關(guān)基因精細定位候選區(qū)間,分布在1、2、11、12、15、16、18、20號染色體上。多數(shù)位點與腫瘤的生物學(xué)特征及臨床指標(biāo)之間無相關(guān)性,也有部分位點與腫瘤分化、淋巴轉(zhuǎn)移、遠處轉(zhuǎn)移、浸潤深度、腫瘤分期等有統(tǒng)計學(xué)意義。 結(jié)論:通過對課題組前期篩選的胃癌15個高頻LOH微衛(wèi)星位點的雜合缺失精細定位分析,發(fā)現(xiàn)了14個范圍較小的高頻雜合缺失區(qū)域,這些區(qū)域內(nèi)的候選基因:APITD1、TNF

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