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![玉米絲黑穗病抗性基因的定位與相關(guān)分子標(biāo)記的發(fā)展.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/67df3f5b-36fc-4f68-82f6-6e4d38b0b599/67df3f5b-36fc-4f68-82f6-6e4d38b0b5991.gif)
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文檔簡介
1、絲黑穗病是玉米生產(chǎn)中最嚴(yán)重的病害之一,在世界范圍內(nèi)發(fā)生,造成玉米產(chǎn)量極大損失。玉米對絲黑穗病的抗性呈數(shù)量性狀遺傳特點(diǎn),受多個(gè)位點(diǎn)控制。本研究旨在發(fā)現(xiàn)玉米抗絲黑穗病的主效QTL(quantitativetraitloci),在此基礎(chǔ)上發(fā)展分子標(biāo)記,飽和主效QTL區(qū)域,為抗病主效QTL的克隆奠定基礎(chǔ)。本研究的主要結(jié)果分以下4個(gè)方面: 1.利用94個(gè)來自于‘吉1037’(高抗,供體親本)和‘黃早四’(高感,輪回親本)BC1∶2家系的材
2、料來定位抗病QTL。在播種時(shí)將上年病源菌與細(xì)土混合覆蓋種子進(jìn)行人工接種,在抽穗后對每個(gè)家系進(jìn)行絲黑穗病抗性鑒定。同時(shí),從700對SSR引物中篩選出357對在兩親本間表現(xiàn)多態(tài)性的引物,從中選定120對擴(kuò)增條帶清晰的SSR分子標(biāo)記用于各個(gè)家系的基因型測定。采用復(fù)合區(qū)間作圖法檢測到兩個(gè)抗性QTL,分別位于第2和第5染色體上。其中第2染色體上的主效QTL(qRHS1)位于分子標(biāo)記umc1736和umc2184之間(bin2.09,遺傳距離為13
3、.5cM),LOD值達(dá)到11.8,可以解釋表型變異達(dá)到36%。第5染色體上的QTL(qRHS2)位于umc2115和bnlg1879區(qū)間內(nèi)(bin5.02,遺傳距離為14.2cM),LOD值達(dá)到3.1,可以解釋的表型變異為9%。 2.查找qRHS1區(qū)域(bin2.09)已定位的IDP、EST和RGA等序列,在此基礎(chǔ)上通過設(shè)計(jì)引物、PCR擴(kuò)增、測序等獲得親本‘吉1037’和‘黃早四’對應(yīng)的序列,比較序列差異后發(fā)展新的分子標(biāo)記。在發(fā)
4、展的6個(gè)分子標(biāo)記中,經(jīng)過定位,發(fā)現(xiàn)有3個(gè)位于主效qRHS1內(nèi),包括一個(gè)CAPS標(biāo)記(C1,來自于IDP25082)、一個(gè)STS標(biāo)記(C3,來自于IDP1944)和一個(gè)SNP標(biāo)記(C4,來自于IDP661);另外,分子標(biāo)記C5(來自于bin2.09的RGA序列)也定位在主效QTL附近,位于bnlg1520上游;最后二個(gè)分子標(biāo)記C2(來自于AZM4140313的標(biāo)記)和C6(來自于BG840810的標(biāo)記)定位不在bin2.09區(qū)域,C2定位
5、于第1染色體的umc1184和umc2189之間;C6定位于第1染色體的分子標(biāo)記umc1403和umc1243之間。 3.在314個(gè)BC1植株中發(fā)現(xiàn)12個(gè)在qRHS1區(qū)域內(nèi)發(fā)生交換的單株。運(yùn)用這12個(gè)BC1交換株和主效qRHS1區(qū)段內(nèi)的SSR及新發(fā)展的分子標(biāo)記,將此抗性基因限定在C4和umc1736之間,遺傳距離為9.2cM。 4.在1750個(gè)BC2植株中,用qRHS1置信區(qū)間兩側(cè)的SSR標(biāo)記umc2184和umc173
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