1、雞馬立克氏?。∕D）是由雞馬立克氏病病毒1型（MDV-1）引起的一種嚴(yán)重危害養(yǎng)禽業(yè)的傳染性淋巴組織增生性疾病。主要臨床癥狀表現(xiàn)為T淋巴細(xì)胞瘤和神經(jīng)麻痹。其病原MDV-1又稱禽皰疹病毒2型，屬于皰疹病毒科，馬立克病毒屬。
　　該病在疫苗的廣泛使用下得到了有效的控制，但近些年來MD流行病學(xué)調(diào)查顯示，中國免疫雞群中MD發(fā)生比例呈明顯上升趨勢(shì)。分離毒株的毒力研究也證明，新分離毒株致病特征發(fā)生變化，病毒毒力明顯增強(qiáng)。在MDV毒力不斷增強(qiáng)，現(xiàn)

2、有MD疫苗不能提供完全保護(hù)的情況下，研究MDV分離毒株分子進(jìn)化規(guī)律和趨勢(shì)，尋找分離毒株毒力相關(guān)因子，是目前防控MD的前提。之前對(duì)中國MDV分離毒株分子進(jìn)化的研究主要集中于少數(shù)幾個(gè)基因，對(duì)于MDV這樣的大基因組病毒，難以反映其真實(shí)分子進(jìn)化規(guī)律。而完成全基因組測(cè)序的中國分離毒株僅僅包括了814、LMS和GX01013株毒株。這些數(shù)據(jù)不能夠充分揭示中國MDV分離毒株的分子進(jìn)化以及探究分離毒株毒力相關(guān)因子。
　　本研究中我們選取6株在20

3、11-2014年分離的中國MDV毒株LCC、LTS、WC/1203、JL/1404、CC/1409和HS/1412株以及1株1974年分離的中國毒株J-1株，進(jìn)行病毒基因組高通量測(cè)序和序列比對(duì)分析。基因組組裝結(jié)果顯示7株測(cè)序毒株基因組大小相似，在176kbp左右，基因組結(jié)構(gòu)符合E類皰疹病毒基因組特點(diǎn)。通過基因組進(jìn)化樹分析，首次從基因組水平證明在過去的二十多年間中國和世界范圍內(nèi)的MDV已經(jīng)進(jìn)化；20世紀(jì)90年代是MDV進(jìn)化的轉(zhuǎn)折點(diǎn)?；蚪M

4、和重要基因、片段進(jìn)化樹分析證明，2000年以后分離的中國毒株具有近的進(jìn)化關(guān)系。經(jīng)過基因組序列比對(duì)分析，證明中國分離MDV毒株包含特異性序列，尤其是在 meq、ICP4、UL36基因和短獨(dú)特區(qū)與末端短重復(fù)區(qū)（US/TRS）連接區(qū)域。其中，meq、 ICP4、UL29基因的點(diǎn)突變，US/TRS連接區(qū)域151-bp插入推測(cè)更可能與中國 MDV新分離毒株毒力增強(qiáng)有關(guān)。另外，單核苷酸突變RLORF4 T11M、RLORF7 P176R/T、UL2

5、9 R506L、RSORF1 K44 R和ICP4 K1948M是中國新分離毒株的特有突變。
　　為了更全面的了解中國MDV分離毒株毒力相關(guān)因子，我們對(duì)中國MDV分離毒株L-MS體外傳代致弱株L-MSp75和L-MSp110及其親本毒株L-MSp5進(jìn)行基因組高通量測(cè)序和序列比對(duì)分析，探究MDV毒株體外進(jìn)化分子變異規(guī)律。序列比對(duì)分析證明，中國MDV分離毒株體外傳代致弱株發(fā)生了大量的插入、缺失和非無義單核苷酸突變。特別是RLORF1、

6、RLORF2、RLORF12、ICP4、US7和 US8基因突變以及內(nèi)部短重復(fù)區(qū)（IRS）上游（TRS下游）601-bp缺失，IRS/US（US/TRS）連接區(qū)域15bp插入、116bp缺失推測(cè)可能與中國MDV分離毒株毒力致弱有關(guān)。結(jié)合上述中國MDV分離毒株毒力增強(qiáng)相關(guān)分子變異結(jié)果，證明ICP4基因和US/TRS連接區(qū)域是中國MDV分離毒株毒力相關(guān)的變異富集區(qū)，是下一步MDV毒力相關(guān)分子研究的重點(diǎn)。
　　本研究首次從基因組水平對(duì)中