發(fā)夾式siRNA活化結(jié)直腸癌高甲基化抑癌基因的實驗研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、CpG島(CpGislands)高甲基化所致抑癌基因表觀遺傳學(xué)沉默(epigeneticsilencing)是腫瘤發(fā)生學(xué)的重要機制之一,已成為腫瘤表觀遺傳學(xué)組(cancerepigenomics)和人類表觀基因組計劃(HumanEpigeneticProjects,HEP)的重要研究內(nèi)容。所謂表觀遺傳學(xué)是指基于非基因序列改變所致基因表達水平變化,如DNA甲基化、染色體轉(zhuǎn)位等。在表觀遺傳學(xué)的研究中,DNA甲基化一方面與人類發(fā)育進程密切相關(guān)

2、,在人類發(fā)育過程中起著重要的基因表達調(diào)節(jié)作用,另一方面,它與腫瘤疾病的發(fā)生發(fā)展也有著極為重要的密切關(guān)系。 結(jié)直腸癌是人類常見腫瘤疾病。抑癌基因CpG島高甲基化是結(jié)直腸癌發(fā)生學(xué)重要機制之一,它不僅與結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展直接相關(guān),還與基因突變/染色體不穩(wěn)定和微衛(wèi)星不穩(wěn)定的進行性演變直接相關(guān)。在結(jié)直腸癌腫瘤發(fā)生學(xué)中,CpG島甲基化異常機制累及的抑癌基因很多,如DNA修復(fù)(MLH1、MGMT)和細胞周期調(diào)控(p16、p53)基因等。由于抑癌

3、基因的CpG島高甲基化現(xiàn)象是可以逆轉(zhuǎn)的表觀遺傳學(xué)修飾過程,并且該逆轉(zhuǎn)(CpG島去甲基化)可直接恢復(fù)抑癌基因的功能,此外,結(jié)直腸癌腫瘤細胞hDNMT1(humanDNAmethyltransferase1)的過度表達又是導(dǎo)致抑癌基因CpG島高甲基化的關(guān)鍵因素,因此,特異性抑制hDNMT1的活性有可能使高甲基化轉(zhuǎn)錄失活的抑癌基因恢復(fù)基因表達和生物學(xué)功能,從而使結(jié)直腸癌腫瘤細胞向正常細胞轉(zhuǎn)變。 RNA干擾(RNAi)是由dsRNA介導(dǎo)

4、的轉(zhuǎn)錄后基因沉默機制,當(dāng)外源導(dǎo)入的dsRNA被Dicer酶切割成19-23nt的小分子干擾RNAs(siRNA)后,與體內(nèi)其他成分聚合形成RNA誘導(dǎo)型基因沉默復(fù)合體(RISC),然后活化的RISC可導(dǎo)致與siRNA互補靶序列的降解,從而導(dǎo)致特異的基因沉默效應(yīng)。RNAi技術(shù)在基因敲除或誘導(dǎo)基因沉默等方面都取得了可喜成果,這些為本課題選擇RNAi機制來抑制hDNMT1的表達提供了理論依據(jù)。 本研究首先設(shè)計靶向hDNMT1mRNA不同

5、位置的hsiRNA913和hsiRNA1620兩條發(fā)夾式siRNA,并以此為模板,通過PCR擴增方式在體外制備可特異性誘導(dǎo)hDMMT1RNAi的SEC913和SEC1620兩條siRNA表達盒(siRNAexpressioncassette,SEC),然后將SEC913和SEC1620分別轉(zhuǎn)染結(jié)直腸癌細胞株HCT116;隨后,將SEC913和SEC1620克隆至pSECneo發(fā)夾式siRNA表達載體,分別構(gòu)建pSECneo913和pSE

6、Cneo1620表達載體,并將其轉(zhuǎn)染結(jié)直腸癌細胞株HCT116和SW480。最后,以β-actin為內(nèi)對照,采用半定量RT-PCR觀察和分析在SEC913、SEC1620、pSECneo913和pSECneo1620轉(zhuǎn)染的HCT116和SW480細胞株中,hDNMT1在不同時相點的表達水平及其變化趨勢與特點,以分析和評價上述RNAi技術(shù)對hDNMT1表達抑制的特異性和效率;同時,采用半定量RT-PCR和MSP(methylationsp

7、ecificPCR)方法,分別觀察p16、MGMT和hMLH1三種抑癌基因的基因表達水平和CpG島甲基化水平,以評價和分析hDNMT1表達抑制作用是否可導(dǎo)致抑癌基因高甲基化水平的逆轉(zhuǎn),并且該逆轉(zhuǎn)可恢復(fù)上述抑癌基因的表達和功能。 研究結(jié)果表明,體外制備的SEC913和SEC1620,以及發(fā)夾式siRNA表達載體pSECneo913和pSECneo1620均可導(dǎo)致轉(zhuǎn)染細胞株HCT116和SW480中hDNMT1表達水平不同程度的下降

8、;此外,發(fā)夾式siRNA的作用時效性遠遠高于體外制備的SEC913和SEC1620,提示發(fā)夾式siRNA表達載體可提供長期有效的RNAi作用,因此,它們在臨床表觀遺傳學(xué)治療方面具有更好的潛在應(yīng)用價值。此外,hDNMT1的表達抑制作用可導(dǎo)致p16和MGMT基因CpG島甲基化水平降低或逆轉(zhuǎn),并可觀察到這些抑癌基因表達水平恢復(fù)或增高,提示抑癌基因高甲基化水平的逆轉(zhuǎn)可恢復(fù)或增強其表達水平。上述研究結(jié)果表明,本研究通過RNAi特異性抑制hDNMT

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