應用熒光定量PCR法對白色念珠菌胞外DNA釋放的動力學研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、侵襲性真菌病是導致免疫缺陷病人和危重病人死亡的主要原因之一。隨著腫瘤、血液病及獲得性免疫缺陷病人的逐年增多,侵襲性真菌病特別是白色念珠菌病日益受到醫(yī)學界的重視。其中,白色念珠菌感染可占臨床念珠菌感染的45%左右。本病危害性大、死亡率高,尚缺乏有效的診斷手段。常規(guī)血液培養(yǎng)陽性率低、耗時長;檢測真菌循環(huán)抗原(體)、特異性酶和代謝產(chǎn)物的血清學方法則存在特異性和敏感性低的缺陷。檢測方法的局限性導致真菌病的早期明確診斷十分困難,是影響患者預后的重

2、要因素之一。因而建立一種特異、靈敏、高效、快速的檢測系統(tǒng)是檢驗工作者急需解決的一個問題。 PCR法可以檢測出微量的真菌DNA,已成為真菌檢測的一個研究熱點。而RealTimePCR,即實時檢測PCR擴增產(chǎn)物并進行解析的方法,不僅秉承和發(fā)展了普通PCR的快速、高靈敏度檢出等全部優(yōu)點,同時克服了普通PCR不能準確定量、容易污染等的不足。由于其操作簡單、快速方便、靈敏度高、重復性好、污染率低等特點,近年來開始受到真菌檢測研究者的關(guān)注。

3、 無論是普通PCR法還是RealTimePCR法檢測菌株的目的都是要為臨床服務,所以臨床標本的選擇很重要。選用血液標本早己達成共識,但具體而言,全血標本和血清標本哪一種更利于真菌的PCR早期檢測,仍然說法不一;并且如何更早地獲得足夠量的檢測模板也是一個急需解決的問題。鑒于此,本實驗試圖通過熒光定量PCR法研究白色念珠菌體外DNA釋放的動態(tài)過程,嘗試用RealTimePCR法檢測真菌,為指導臨床早期檢測侵襲性真菌病提供一定的依據(jù)。

4、 本研究以白色念珠菌rRNA基因復合體為靶標,采用prime5.O軟件包設計了一對白色念珠菌特異性引物,以白色念珠菌DNA為模板,并以其他菌種的念珠菌屬及臨床上常見的細菌DNA為陰性對照,進行PCR擴增,結(jié)果顯示該引物的特異性良好。將獲得的擴增產(chǎn)物進行測序和比對分析發(fā)現(xiàn)該測序結(jié)果與目的基因序列相同,進一步證實了PCR擴增的準確性和可靠性。 通過系列稀釋提取的白色念珠菌的核酸,發(fā)現(xiàn)使用常規(guī)PCR儀(Biometra公司)檢

5、測白色念珠菌DNA的靈敏度是100fg或者10一20個菌;而使用熒光定量PCR儀HghtCycler1.0系統(tǒng)(羅氏公司)檢測白色念珠菌DNA的靈敏度是10fg。 在上述實驗的基礎上,觀察白色念珠菌DNA釋放到胞外的動態(tài)過程。通過8個不同時間點提取上清中DNA量的變化情況,觀察了白色念珠菌在4種不同培養(yǎng)基中隨時間變化釋放到胞外的動態(tài)過程,以及加入單核吞噬細胞后對白色念珠菌DNA釋放的影響程度。 為進一步驗證血清和全血沉淀

6、物中DNA的主要存在方式,我們設計以下實驗,即在人全血中加入白色念珠菌孢子(代表真菌細胞內(nèi)的DNA)和光滑念珠菌基因組DNA(代表游離DNA)。經(jīng)離心后得到上清和沉淀物,分別提取DNA后,以白色念珠菌和光滑念珠菌特異的引物進行熒光定量PCR擴增。結(jié)果顯示游離DNA主要存在于血漿中,而真菌細胞內(nèi)的DNA主要存在于全血沉淀物中。 綜上所述,本研究采用熒光定量PCR的方法,觀察了白色念珠菌DNA釋放到胞外的動態(tài)過程,發(fā)現(xiàn)單核吞噬細胞在

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