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![尼古丁對人氣道上皮基因組和蛋白組學(xué)的影響.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/fb248eac-addf-468a-8e07-f7a0bc41e08d/fb248eac-addf-468a-8e07-f7a0bc41e08d1.gif)
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文檔簡介
1、目的:
吸煙是引起慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的主要原因。氣道重塑是COPD不可逆性氣流受限的主要原因。一般認(rèn)為,COPD氣道重塑的機制與炎癥細胞活化、氧化抗氧化失衡、蛋白酶抗蛋白酶失衡、細胞凋亡等有關(guān)。最近,越來越多的研究表明上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)分化(epithelial mesenchymal transdifferentiation,EMT)參與了氣道重塑
2、的發(fā)生。氣道上皮作為抵御外來損傷因素的第一道防線,吸入的煙草煙霧進入人體最先直接接觸人體的氣道。尼古丁是香煙煙霧中的主要有害成分。尼古丁對氣道上皮的直接影響目前還不清楚。本研究首次采用基因芯片技術(shù)和雙向凝膠電泳技術(shù)觀察尼古丁刺激人氣道上皮細胞后差異基因和蛋白的表達情況,為進一步闡明氣道重塑機制提供線索。
方法:
一、體外培養(yǎng)原代人小氣道上皮細胞,待原代人氣道上皮細胞生長至80%融合時,換用無生長因子的基礎(chǔ)培養(yǎng)基培養(yǎng)2
3、4小時,使細胞同步于靜止期。將細胞隨機分成兩組,每組再分成兩個平行組,即尼古丁刺激4小時組和空白對照組,尼古丁刺激48小時組和空白對照組。實驗組加入尼古?。?310-5M),對照組加入PBS,分別孵育4小時和48小時后吸走,加入Trizol試劑,收集細胞用于基因芯片檢測。
二、根據(jù)基因芯片結(jié)果,選取部分表達差異基因用熒光定量PCR方法進行驗證。
三、體外培養(yǎng)人支氣管上皮細胞16HBE,待16HBE細胞生長至80%融合
4、時,換含1%的胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)24小時,使細胞同步于靜止期。采用隨機化的原則進行分組:(1)對照組,加入PBS;(2)實驗組,加入尼古?。ńK濃度1310-5M),孵育72小時后加入裂解液收集細胞用于雙向凝膠電泳。通過雙向凝膠電泳實驗分離總蛋白,差異表達蛋白質(zhì)點應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜獲取肽質(zhì)量指紋圖譜并通過 NCBI數(shù)據(jù)庫鑒定。
結(jié)果:
一、基因芯片結(jié)果
(1)尼古丁處理4h后,表達
5、上調(diào)的基因有63個,表達下調(diào)的基因有44個,主要涉及細胞對外界刺激的應(yīng)激反應(yīng)有關(guān)基因。
?。?)尼古丁處理48h后,表達上調(diào)的基因有860個,表達下調(diào)的基因有582個。對差異基因進行Gene GO分析和Pathway分析,發(fā)現(xiàn)差異基因涉及到胚胎發(fā)育、細胞極性維持、細胞與細胞黏附等與細胞轉(zhuǎn)分化相關(guān)的重要生理過程和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。
?。?)進一步對個別基因進行分析,發(fā)現(xiàn)尼古丁可以下調(diào)上皮角蛋白(CK)、上皮黏蛋白(MUC)等具
6、有上皮特征的基因;上調(diào)纖維連接蛋白1(FN1)、N鈣粘蛋白(N-cadherin)等具有間質(zhì)細胞特征的基因。
二、熒光定量PCR結(jié)果熒光定量PCR驗證的基因差異表達與基因芯片結(jié)果變化趨勢一致。
三、雙向凝膠電泳結(jié)果
雙向凝膠電泳圖譜中找到23個表達量有明顯差異的蛋白質(zhì)點,質(zhì)譜鑒定出19種蛋白質(zhì)。其中與細胞骨架相關(guān)的蛋白明顯下調(diào),如微管蛋白、γ1-肌動蛋白等。
結(jié)論:
不論從基因組水平還是
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