我國(guó)東黃海鳀魚(yú)自然群體的遺傳多樣性研究.pdf_第1頁(yè)
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1、中國(guó)海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文我國(guó)東黃海鰣魚(yú)自然群體的遺傳多樣性研究姓名:郭天慧申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專(zhuān)業(yè):水生生物學(xué)指導(dǎo)教師:喻子??讜澡?002.6.6我國(guó)東黃海鯉魚(yú)自然群體的遺傳多樣性研究(二)線粒體DNAcytb基因序列多態(tài)性分析:從上述的3個(gè)鯤魚(yú)群體一、二、三中分別取15、16、15個(gè)個(gè)體,經(jīng)PCR擴(kuò)增、測(cè)序,得到長(zhǎng)度為420bp的cytb基因片段的核苷酸序列。在總?cè)后w中共檢測(cè)到24個(gè)多態(tài)性核苷酸位點(diǎn),歸為29種單倍型。其中,群體一、二

2、、三擁有的多態(tài)位點(diǎn)數(shù)和單倍型分別為16和12,14和12,12和13。在多態(tài)位點(diǎn)數(shù)S、平均核苷酸差異數(shù)K和核苷酸多樣性指數(shù)Pi三個(gè)指標(biāo)上,群體~的值相對(duì)較高,這表明3個(gè)群體中以群體一的遺傳多樣性最高,其余兩個(gè)群體次之。三個(gè)群體間的遺傳距離在00060007之間,沒(méi)有明顯的群體分化,分子系統(tǒng)樹(shù)也表明我國(guó)東黃海海域的鯤魚(yú)自然群體未出現(xiàn)明顯的地理遺傳分化,屬于同一個(gè)母系祖先,這與RAPD的分析結(jié)果相一致。另外,通過(guò)生物信息學(xué)的方法,初步分析了

3、鯡形目魚(yú)類(lèi)莎瑙魚(yú)屬、黍鯡屬、鯡屬、小沙丁魚(yú)屬、沙丁魚(yú)屬、鰓屬等6個(gè)屑,15種的cytb基因片段的分子進(jìn)化系統(tǒng)。結(jié)果表明,鯡形目魚(yú)類(lèi)這6個(gè)屬15種的cytb基因片段的分子系統(tǒng)樹(shù)與傳統(tǒng)分類(lèi)學(xué)基本相一致。關(guān)鍵詞:鯤魚(yú);遺傳多樣性:RAPD;線粒體DNA;cytb基因GenetiCDiversityStudieSinNatureJPopuJatiODSofEngrauIisjaponicusofDongHaiandYeIIOWSeaAbstra

4、ct:GeneticdiversityinthreenaturalpopuIationsoff諺a“l(fā)isjaponicuscoI|ectedfromOUrseaareaofDongHaiandYelIowSeawasanaIyzedbyusingRAPDtechniqueandDNAsequeRceTherandomlyamplifiedpolymorphicDNA(RAPD)techniquehasbecomeapowerfuige

5、neticmarkerforestimatingpolymorphismwithinspeciesandpopulationsThetechniqueWaSusedtoexaminegeneticdiversityinEngraulisjaponicusfromthethreepopulationsInitially,10oligonucleotideprimers(S101一S140;Sangon,Canada)werescreene

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