雜色鮑(Haliotis diversicolor)響應細菌攻毒血淋巴細胞差異表達基因的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、鮑以其豐富的營養(yǎng)價值在民間一直被認為是與魚翅、燕窩齊名的營養(yǎng)食品。養(yǎng)殖鮑市場價格高且穩(wěn)定,銷路暢通,利潤空間大,深受水產(chǎn)養(yǎng)殖戶的歡迎,是我國重要的海水養(yǎng)殖經(jīng)濟物種。雜色鮑(Haliotis diversicolor Reeve,1846)隸屬于軟體動物門,腹足綱,前鰓亞綱,原始腹足目,鮑科,是我國南方鮑種,因其生長迅速,一直在南方沿海海域得到廣泛的養(yǎng)殖。但近年來由于養(yǎng)殖海域水質(zhì)影響及養(yǎng)殖鮑種自身退化,使得人工養(yǎng)殖雜色鮑抗病力低,時有疫病

2、發(fā)生,給養(yǎng)鮑業(yè)帶來很大的經(jīng)濟損失。因此,尋求免疫防治是保障鮑養(yǎng)殖業(yè)健康發(fā)展的重要措施,但迄今有關鮑免疫機制的研究報道較少。本項研究應用抑制性差減雜交(SSH)技術篩選細菌攻毒雜色鮑免疫相關基因,為深入探討鮑抗細菌感染免疫機制奠定基礎。 1.成功構建細菌攻毒雜色鮑血淋巴細胞SSH cDNA文庫血淋巴細胞是鮑免疫系統(tǒng)中重要的免疫細胞,本研究以雌性雜色鮑為對象,以副溶血弧菌(Vibrioparahaemeolyticus)、大腸桿菌(

3、Escherichia coli)、溶壁微球菌(Micrococcuslsodeikticus)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)五種細菌混懸液為攻毒菌,利用SSH技術,成功構建細菌攻毒雜色鮑血淋巴細胞SSH cDNA文庫,該文庫容量為1.37×106 cfu,重組效率為98.18%。 2.克隆獲得111個雜色鮑血淋巴細胞表達基因隨

4、機測序435個重組子,經(jīng)序列分析和拼接,總計克隆獲得111個雜色鮑血淋巴細胞表達基因。利用 AmiGO基因本體釋義工具,將其分為11個基因群,11個基因(9.9%)參與細胞蛋白質(zhì)代謝過程;8個基因(7.2%)參與產(chǎn)生前體代謝物和能量的生物學過程;5個基因(4.5%)參與異生質(zhì)代謝等其他細胞代謝過程;10個基因(9.0%)參與細胞組分生物合成與裝配過程;6個基因(5.4%)參與機體信號傳導;8個基因(7.2%)參與生物調(diào)控:8個基因(7.

5、2%)參與免疫系統(tǒng)過程;8個基因(7.2%)參與應激反應過程;4個基因(3.6%)分別參與不同的生物學過程被合為一個其他功能基因群;40個基因(36.0%)屬于完全未知功能的基因;3個基因(2.7%)是rRNA基因。BLAST同源序列搜索分析發(fā)現(xiàn)25個基因(22.52%)在GenBank數(shù)據(jù)庫中搜索到來源于腹足綱動物的同源基因信息,其他86個基因(77.48%)均是首次在腹足綱動物中發(fā)現(xiàn)。 3.確定了52個上調(diào)表達的基因利用半定

6、量PCR和real—time PCR兩種基因差異表達分析方法共同證實52個基因在細菌攻毒36—40 h的雜色鮑血淋巴細胞中表現(xiàn)不同程度的差異表達。其中47個基因(42.34%)在細菌攻毒血淋巴細胞中上調(diào)表達,5個基因(4.5%)在生理鹽水對照組上調(diào)表達。 4.擴增獲得86個基因的特異基因組DNA片段通過PCR擴增基因組DNA片段和 BLASTn同源搜索證實所克隆的雜色鮑血淋巴細胞表達基因無細菌基因組DNA污染。86個目的基因可擴

7、增出特異基因組DNA片段,其中46個基因的基因組DNA在擴增引物之間無內(nèi)含子序列;40個基因的基因組DNA序列在擴增引物之間存在內(nèi)含子。通過Southern blotting和DNA測序證實β—thymosin基因(Thym—β)的基因組DNA序列至少含有兩個基因組拷貝,其中一個基因拷貝不含內(nèi)含子,另一個基因拷貝含有兩個內(nèi)含子,第一內(nèi)含子477 bp,第二內(nèi)含子2818bp。 5.揭示了16個基因的全長cDNA序列利用SMART

8、技術和游離PCR、錨定PCR原理,較為經(jīng)濟的批量擴增克隆了16個雜色鮑血淋巴細胞表達基因全長cDNA序列,其中GlSTrs、Profilin、TIMp、PreP2、Thym—β、Ferritin、Calp、Hypo等8個基因是在細菌攻毒36—40 h雜色鮑血淋巴細胞中上調(diào)表達基因。 6.分析了14個基因在鮑體內(nèi)的差異表達特性利用半定量PCR和熒光定量PCR方法分析GlSTrs、Thym—β、AlInFa、CYP7A1、KLF、f

9、erritin、Hypo2、MMPvar、CDD、SOCS-2、Profilin、Hypo、TIMp、UbCoE等14個基因的差異表達特性。證實GlSTrs、CYP7A1、Hypo2、TIMp、CDD、AlInFa、MMPvar、Hypo等8個基因受細菌誘導時間影響在血淋巴細胞內(nèi)顯著的上調(diào)表達。 本項研究首次從基因組學的角度出發(fā),分析雜色鮑響應細菌攻毒血淋巴細胞差異表達基因。鮑免疫相關基因的研究為進一步探討鮑抗感染免疫機制和提高

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