1、香菇(Lentinula edodes)目前已是世界上產(chǎn)量?jī)H次于雙孢蘑菇的人工栽培食用菌，是東亞地區(qū)最重要的食用菌之一。中國(guó)幅員遼闊，有著相當(dāng)豐富的香菇自然種質(zhì)資源，這些自然種質(zhì)資源為香菇的遺傳育種提供了優(yōu)良材料。香菇大多數(shù)農(nóng)藝性狀和經(jīng)濟(jì)性狀表現(xiàn)為連續(xù)變異的數(shù)量性狀，受多基因控制，易受環(huán)境影響，采用常規(guī)育種方法很難對(duì)這些性狀進(jìn)行改良。分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展為分子標(biāo)記輔助育種提供了可能性。香菇QTL定位工作尚處于起步階段，存在亟待改進(jìn)之處。以

2、連鎖不平衡為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)分析方法為香菇數(shù)量性狀的遺傳研究提供了新的方法，也為香菇分子標(biāo)記輔助育種研究提供了新的思路。
　　 本研究以采集于全國(guó)14個(gè)省份的香菇93個(gè)野生菌株和1個(gè)栽培菌株為研究材料，利用篩選出的34對(duì)SSR分子標(biāo)記，對(duì)群體進(jìn)行全基因組分子掃描，分析我國(guó)野生香菇的遺傳多樣性及群體結(jié)構(gòu)，利用基于連鎖不平衡的關(guān)聯(lián)分析方法，對(duì)香菇13個(gè)數(shù)量性狀與34個(gè)SSR分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行了研究。主要結(jié)果如下:
　　 1.利用

3、34對(duì)SSR標(biāo)記對(duì)94個(gè)香菇菌株進(jìn)行遺傳多樣性、主成分分析(PCA)和群體結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明，34對(duì)引物共擴(kuò)增出169條帶，其中多態(tài)性條帶為162條，多態(tài)性為95.9％。期望雜合度（He）、多態(tài)性信息含量(PIC)和Shannon信息指數(shù)平均值分別為0.44、0.4和0.89，表明我國(guó)香菇野生菌株存在較高的遺傳多樣性，可以作為關(guān)聯(lián)分析的材料。利用UPGMA聚類分析、主成分分析(PCA)和群體結(jié)構(gòu)分析均可將94個(gè)菌株劃分為3個(gè)主要類群，三

4、者結(jié)果之間具有較高一致性。
　　 2.對(duì)34對(duì)SSR標(biāo)記位點(diǎn)形成的561個(gè)成對(duì)組合位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡分析，共有150個(gè)位點(diǎn)組合存在一點(diǎn)程度的連鎖不平衡，占總位點(diǎn)組合數(shù)的26.74％，連鎖不平衡度都較低，大部分集中在0-0.2之間?；趓2統(tǒng)計(jì)概率P＜0.01支持的不平衡組合位點(diǎn)數(shù)為67，占不平衡成對(duì)組合位點(diǎn)數(shù)的44.67％，占總位點(diǎn)組合數(shù)的11.94％，r2＞0.2的組合位點(diǎn)數(shù)僅有3對(duì)，占總組合位點(diǎn)數(shù)的0.53％。
　　

5、 3.利用TASEEL2.0軟件中的一般線性模型對(duì)34個(gè)SSR標(biāo)記位點(diǎn)與13個(gè)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，共檢測(cè)出6個(gè)與4個(gè)性狀顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)。其中與木屑培養(yǎng)基生長(zhǎng)速度顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有3個(gè)，分別為IS017、LEP2和X015，其變異解釋率分別為26.49％、16.59％和33.91％，總解釋率達(dá)到76.99％。位點(diǎn)LEN41與菌蓋直徑顯著關(guān)聯(lián)，變異解釋率為17.04％。位點(diǎn)LTY1與菌蓋厚度顯著關(guān)聯(lián)，變異解釋率為31.65％;位點(diǎn)F041與原基

6、期顯著相關(guān)聯(lián)，變異解釋率為9.9％。
　　 4.進(jìn)一步分析與性狀顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異，發(fā)掘出對(duì)農(nóng)藝性狀具有優(yōu)異等位變異的典型載體材料。結(jié)果表明，在與木屑培養(yǎng)基生長(zhǎng)速度顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的等位變異中，X015-1增效表型效應(yīng)最大;在與菌蓋直徑顯著關(guān)聯(lián)的等位變異中，LEN41-1增效表型效應(yīng)最大;在與菌蓋厚度顯著關(guān)聯(lián)的等位變異中，LTY1-2增效表型效應(yīng)最大;在與原基期顯著關(guān)聯(lián)的等位變異中，F(xiàn)041-1減效表型效應(yīng)最大。本試驗(yàn)研究結(jié)